针对员工生病后公司内部发起捐款的处理问题，核心在于确保流程合法合规、尊重员工隐私与意愿，同时维护公司内部团结。以下是具体处理建议：

1. 明确捐款性质与目的
   首先需明确捐款是自愿行为，公司不得强制或变相强制员工参与。建议通过内部通知或会议说明捐款用途（如直接用于患病员工医疗费用、生活补助等），并承诺专款专用，避免后续纠纷。

2. 尊重患病员工隐私权
   若员工尚未公开病情，公司应事先征得其同意再发起捐款，避免泄露其健康信息。若员工不愿接受捐款，公司需尊重其选择，不得强行干预。

3. 规范捐款流程与记录

   • 发起方式：可通过公司内部平台、工会或指定负责人统一收集捐款，避免私下转账导致管理混乱。
     
   • 金额透明：建议不公开具体捐款人及金额，仅公示总金额及使用方向（如“共筹集X元，已转交员工家属”）。
     
   • 票据留存：若捐款通过公司账户或工会账户进行，需保留转账记录、收据等凭证，以备后续审计或员工查询。

4. 避免法律风险

   • 不承诺回报：明确捐款为无偿赠与，不得暗示或承诺未来给予捐款人特殊待遇（如晋升、加薪等），否则可能涉嫌利益输送。
     
   • 税务合规：若公司以企业名义捐款，需注意企业所得税扣除限额；若员工个人捐款，可建议其保留凭证以便个人所得税专项扣除（如符合公益捐赠条件）。

5. 后续关怀与反馈
   捐款结束后，公司可代表员工向捐款人表达感谢（如内部公告、邮件等），但需避免过度公开员工病情细节。若员工康复后愿意分享经历，可组织分享会增强团队凝聚力，但需以员工意愿为前提。

特殊情况处理：

• 若员工因病离职，公司仍可发起捐款，但需明确捐款用途（如医疗补助、家庭困难帮扶等），并确保资金直接交付员工或其家属。
  
• 若捐款金额较大（如超过员工年收入一定比例），建议提前与员工沟通使用计划，避免因资金闲置或使用不当引发争议。

如有具体操作中的疑问（如流程设计、协议起草等），可直接向我咨询，我会结合实际情况提供进一步建议。