已经执行完毕的刑事案件，再审阶段检察院撤诉是合法的，但需满足特定条件。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律依据与撤诉条件
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，检察院在再审阶段撤诉（通常称为“撤回抗诉”或“撤回起诉”，在再审语境下多指撤回抗诉引发的再审程序终结）需满足以下条件：
证据变化或新发现：若检察院在再审过程中发现原判决、裁定认定事实或适用法律确有错误，但因证据变化或新发现的事实，认为不再需要追究被告人刑事责任，或原抗诉理由不再成立，可申请撤回抗诉。
被告人无罪或罪轻：若再审中检察院认为被告人可能无罪，或原判量刑过重，且通过撤回抗诉可实现更公正的司法结果，也可申请撤诉。
程序合法性：撤诉申请需经检察院内部审批，并报请上级检察院或法院同意（具体程序依案件性质和级别而定），确保撤诉决定的合法性与正当性。
二、撤诉的法律后果
再审程序终结：检察院撤诉后，法院将裁定终结再审程序，原判决、裁定在法律上视为未被撤销，继续有效。但若撤诉因原判错误且需纠正，法院可能通过其他方式（如建议检察院重新抗诉、启动审判监督程序等）实现司法公正。
被告人权益保障：撤诉对被告人而言，通常意味着原判决、裁定不再受再审审查，被告人可避免因再审可能带来的不利后果（如加重刑罚）。但若撤诉后发现新证据或事实，仍可能面临新的法律追究。
三、实际案例与操作要点
案例参考：实践中，检察院撤诉多见于原判证据不足、被告人认罪认罚且情节轻微、或发现新证据证明被告人无罪等情形。例如，某案中原判被告人有罪，但再审中检察院发现关键证据系伪造，遂申请撤诉，法院裁定终结再审，被告人获释。
操作要点：
四、特殊情况与注意事项
撤诉后的救济途径：若被告人认为撤诉决定损害其权益（如原判错误未纠正），可通过申诉、申请国家赔偿等方式寻求救济。
撤诉与审判监督程序的关系：撤诉并不排除法院依职权启动审判监督程序的可能性。若法院认为原判确有错误，可依职权裁定再审，不受检察院撤诉影响。
总结来说，已经执行完毕的刑事案件，再审阶段检察院撤诉是合法的，但需满足特定条件并遵循严格程序。撤诉后，原判决、裁定继续有效，但被告人及司法机关仍需关注案件可能的新发展。若你对具体案件有疑问，可直接向我咨询，我将结合案情为你提供专业法律意见。