职务侵占并非一般通过协商处理，但协商在特定方面仍具有作用。以下是对此问题的详细分析：
一、职务侵占的性质与处理原则
职务侵占是指公司、企业或其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，且数额较大的行为。这是一种明确的违法行为，不仅损害了单位的财产权益，也破坏了社会的公平和正义。由于职务侵占行为一旦达到刑法规定的立案标准，就属于公诉案件，由检察机关代表国家提起诉讼，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。因此，当事人之间不能自行协商免除犯罪嫌疑人的刑事责任。
二、协商在职务侵占案件中的作用
尽管职务侵占案件不能通过协商来免除刑事责任，但协商在以下方面仍具有一定的作用：
赔偿损失：
- 职务侵占涉及到对公司财产权益的侵害，因此当事人之间可以就赔偿问题进行协商。
- 侵占者主动退还侵占的财物或与公司达成赔偿协议，以弥补公司遭受的经济损失，这有助于减少公司的实际损失，并可能体现侵占者的悔罪态度。
- 赔偿损失并不能完全免除侵占者的法律责任，但可能在后续司法程序中作为从轻处罚的情节予以考虑。
取得谅解：
- 若侵占者积极与公司沟通协商，并通过退赔等方式弥补公司损失，有可能获得公司的谅解。
- 公司出具的谅解书在司法程序中可能被视为一个积极的悔罪表现，从而在一定程度上影响量刑。
- 谅解并不等同于免除刑事责任，只是可能作为量刑时的一个参考因素。
三、职务侵占案件的调解可能性与限制
调解范围限制：
- 职务侵占罪的定罪和量刑部分不能通过调解来决定。这是因为刑事案件的追诉权由国家行使，当事人之间不能私下就刑事责任进行交易或妥协。
财产损失的和解：
- 对于职务侵占所造成的被害人财产损失部分，双方可以在自愿、合法的基础上进行和解。如果犯罪嫌疑人积极退赔，与被害人达成和解协议，并取得被害人谅解，法院在量刑时会将此作为从轻处罚的情节予以考虑。
特定条件下的刑事和解：
- 根据《刑事诉讼法》的相关规定，对于某些因民间纠纷引起的涉嫌犯罪案件，如果犯罪嫌疑人真诚悔罪，并通过赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，且被害人自愿和解的，双方当事人可以和解。但这并不意味着犯罪嫌疑人可以免除刑事责任，只是可能在量刑上得到从轻处理。
四、实践建议
侵占者：
- 应及时认识到自己的错误，主动与公司协商赔偿事宜，并积极配合司法机关的工作。
- 通过法律途径寻求从轻处罚的可能性，如积极退赔、取得谅解等。
公司：
- 应尽快向公安机关报案，配合调查，收集证据，以确保案件的顺利处理。
- 在协商过程中，应坚持原则，确保自身权益不受进一步侵害。
综上所述，职务侵占行为不能通过简单的协商来解决刑事责任问题，但协商在赔偿损失和取得谅解方面仍具有一定的作用。对于任何形式的侵占行为，我们都应坚决予以打击和制止，同时鼓励侵占者主动承担责任，通过法律途径寻求从轻处罚的可能性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。