结论：长期的试用期三个月是否合法，主要取决于劳动合同的具体期限。若劳动合同期限为三年以上固定期限或无固定期限，则约定三个月试用期是合法的；若劳动合同期限不满三年，则约定三个月试用期不合法。

法律依据与分析

根据《中华人民共和国劳动合同法》第十九条的规定，我们可以明确以下几点：

1. 劳动合同期限与试用期的对应关系：

   • 劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月。
   • 劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月。
   • 三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。

2. 试用期三个月的合法性分析：

   • 合法情形：当劳动合同期限为三年以上固定期限或无固定期限时，约定三个月的试用期是符合法律规定的。这是因为法律允许在此类合同中设定最长不超过六个月的试用期，三个月自然在此范围内。
   • 不合法情形：若劳动合同期限不满三年（如一年或两年），却约定了三个月的试用期，则违反了法律规定。在此情况下，劳动者有权与用人单位协商调整试用期至法定范围内，或向劳动监察部门投诉举报用人单位的违法行为。

3. 其他注意事项：

   • 同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期，无论劳动合同期限长短。
   • 以完成一定工作任务为期限的劳动合同或者劳动合同期限不满三个月的，不得约定试用期。
   • 试用期包含在劳动合同期限内，劳动合同仅约定试用期的，试用期不成立，该期限应视为劳动合同期限。

劳动者权益保护建议

当试用期约定不合法时，劳动者的权益可能受到侵害，如面临不合理的工资待遇、无法享受应有的福利待遇等。在此情况下，劳动者可以采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商：首先尝试与用人单位沟通，要求调整试用期至法定范围内，或就其他相关权益进行协商。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉举报用人单位的违法行为，要求其依法处理。
3. 申请劳动仲裁：在必要时，劳动者还可以申请劳动仲裁来寻求法律救济和赔偿，确保自己的合法权益得到充分保障。

综上所述，长期的试用期三个月是否合法，完全取决于劳动合同的具体期限及试用期的约定方式。劳动者在签订劳动合同时应仔细审查相关条款，确保自己的权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。