可研单位（可行性研究单位）和施工单位之间可以存在控股关系，但需根据具体情境和法律法规要求来判断其合法性及合规性。以下从不同角度进行分析：

1. 法律法规层面

• 一般原则：在法律法规未明确禁止的情况下，企业之间的控股关系本身并不违法。可研单位和施工单位作为独立的市场主体，有权根据自身战略和市场需求进行股权结构安排。
• 特定行业限制：然而，在某些特定行业或领域，如工程建设、政府采购等，可能存在对控股关系的特别限制或要求。例如，为了避免利益冲突和保证公平竞争，某些项目可能要求可研单位和施工单位之间保持独立，不得存在控股关系。因此，在具体项目中，需仔细审查相关法律法规和招标文件等要求。

2. 实际操作层面

• 利益冲突管理：即使法律法规未明确禁止，可研单位和施工单位之间存在控股关系也可能引发利益冲突问题。例如，可研单位在编制可行性研究报告时可能倾向于选择自己控股的施工单位，从而损害其他潜在投标人的利益。因此，在实际操作中，需建立有效的利益冲突管理机制，确保决策过程的公正性和透明度。
• 合规性审查：在涉及政府投资或公共利益的项目中，通常需要进行严格的合规性审查。这包括审查项目参与各方的股权结构、关联关系等，以确保项目符合法律法规和政策要求。因此，在存在控股关系的情况下，需提前进行合规性评估，并准备相应的应对措施。

3. 建议与注意事项

• 提前咨询与审查：在计划建立或维持可研单位和施工单位之间的控股关系时，建议提前咨询相关法律法规和政策要求，并进行合规性审查。这有助于避免潜在的法律风险和合规问题。
• 建立透明机制：为了维护市场公平竞争和避免利益冲突，建议建立透明的决策机制和利益冲突管理机制。这包括公开招标、公平评审、利益冲突申报等措施。
• 关注行业动态：由于法律法规和政策要求可能随时间发生变化，因此建议持续关注行业动态和政策更新，以便及时调整股权结构和业务策略。

总结来说，可研单位和施工单位之间可以存在控股关系，但需根据具体情境和法律法规要求来判断其合法性及合规性。在实际操作中，需建立有效的利益冲突管理机制和合规性审查机制，以确保决策过程的公正性和透明度。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。