结论前置：公司贷款中小股东征信上显示为共同还款责任人，而内部又签订了责任协议的情况下，该内部协议的有效性需根据具体情况来判断，但内部协议在符合法律规定和双方真实意思表示的情况下，通常是有效的，不过其效力范围可能仅限于协议双方，不能对抗外部债权人。以下从多个角度进行分析：
一、内部协议的有效性
法律基础：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体之间可以依法设立、变更、终止民事法律关系。因此，公司内部股东之间签订的责任协议，只要内容合法、双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，通常是有效的。
协议内容：
- 内部协议应明确约定各方的权利义务，包括但不限于还款责任、违约责任等。协议内容应具体、明确，避免模糊不清或产生歧义。
签订程序：
- 协议的签订应遵循公司章程和法律法规的规定，确保程序合法。例如，如果协议涉及公司重大事项，可能需要经过股东会或董事会的决议。
二、内部协议与外部征信的关系
征信记录的效力：
- 征信记录是金融机构评估借款人信用状况的重要依据。一旦小股东的征信上显示为共同还款责任人，这通常意味着金融机构已经将其视为共同借款人或担保人，并据此进行了信用评估。
内部协议的对外效力：
- 内部协议虽然在公司内部股东之间具有约束力，但其效力通常不能对抗外部债权人。也就是说，即使内部协议约定了小股东不承担还款责任，但如果征信记录上显示其为共同还款责任人，金融机构仍有权要求其承担还款义务。
三、可能的风险与应对措施
风险：
- 小股东可能因征信记录上的共同还款责任人而面临被金融机构追偿的风险。
- 如果公司无法按时还款，小股东的信用状况可能受到影响，进而影响其未来的融资能力。
应对措施：
- 与金融机构沟通：小股东可以尝试与金融机构沟通，解释内部协议的情况，并寻求金融机构的理解和支持。但需注意，金融机构可能更倾向于依据征信记录来评估信用状况。
- 法律途径：如果小股东认为其权益受到侵害，可以寻求法律途径解决。例如，可以起诉公司或其他股东违反内部协议，要求其承担违约责任。但需注意，这并不能直接免除其对金融机构的还款义务。
- 完善内部协议：未来在签订类似协议时，应充分考虑征信记录的影响，并明确约定各方在征信记录方面的责任和义务。例如，可以约定由公司或其他股东负责向金融机构解释内部协议的情况，并确保征信记录的准确性。
四、特殊情况下的考虑
- 如果小股东在签订内部协议时存在欺诈、胁迫等情形，或者协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，那么该协议可能被认定为无效。在这种情况下，小股东可以依法主张协议无效，并寻求相应的法律救济。
总结与建议：公司贷款中小股东征信上显示为共同还款责任人，而内部又签订了责任协议的情况下，内部协议在符合法律规定和双方真实意思表示的情况下通常是有效的。但需注意，其效力范围可能仅限于协议双方，不能对抗外部债权人。因此，小股东在签订此类协议时应谨慎考虑征信记录的影响，并采取相应的风险应对措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。