核心结论：在执行程序中，若申请方未开具发票，被执行方可依据合同约定或法律规定采取以下措施维护权益，具体需结合交易性质、合同条款及执行阶段综合判断。以下分情况说明：

1. 若合同明确约定“先票后款”条款

• 法律依据：根据《民法典》第五百二十六条，当事人互负债务，有先后履行顺序的，先履行一方未履行的，后履行一方有权拒绝其履行请求（即“先履行抗辩权”）。
• 操作建议：
  • 执行阶段抗辩：在执行程序中，被执行方可向法院提出书面异议，主张申请方未履行开具发票的先合同义务，请求法院中止执行或要求申请方先履行开票义务。
  • 证据准备：需提供合同原件、付款凭证、催告开票的书面记录（如邮件、函件）等，证明对方未履行义务且己方已履行付款义务。

2. 若合同未约定开票顺序，但开票是法定义务

• 法律依据：根据《增值税暂行条例》第二十一条，销售方开具发票是法定义务，无论合同是否约定。若申请方为销售方，未开票可能涉及偷逃税款，被执行方可向税务机关举报。
• 操作建议：
  • 税务举报：向当地税务局提交书面举报材料，附上交易合同、付款凭证等证据，要求税务机关责令申请方开具发票并处罚。
  • 执行程序补充：在执行程序中，可申请法院向税务机关调取申请方的纳税记录，证明其未履行开票义务，进而主张抵扣税款或赔偿损失（如因无法抵扣导致的多缴税款）。

3. 若执行标的已包含税款，申请方拒不开票

• 核心风险：若执行款项已包含增值税等税款，申请方拒不开票可能导致被执行方无法抵扣税款，造成实际损失。
• 操作建议：
  • 提起另诉：以“合同纠纷”或“不当得利”为由，另行起诉申请方，要求其开具发票或赔偿税款损失（需提供税款计算依据及税务机关出具的无法抵扣证明）。
  • 执行和解：在执行程序中与申请方协商，要求其开具发票后继续执行，或从执行款中扣除相应税款金额。

4. 特殊情形：申请方已丧失开票能力（如注销、吊销）

• 处理方式：
  • 税务代开：若申请方已注销，可向税务机关申请代开发票（需提供合同、付款凭证等材料）。
  • 损失主张：若因申请方注销导致无法开票，可主张其股东或实际控制人承担赔偿责任（需证明注销行为存在恶意或过错）。

温馨提示：实务中需注意：

1. 合同条款是关键，建议未来在合同中明确约定“开票与付款的先后顺序”及“违约责任”；
   
2. 执行程序中提出异议需在法定期限内（通常为收到执行通知后10日内）；
   
3. 税务举报需以真实交易为基础，避免虚假举报承担法律责任。
   

如有具体案件材料或细节需要进一步分析，可直接向我咨询。