检察院对小卖部进行检查本身并不违法，但需遵循法定程序和权限。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、检察院的法定职权与检查范围
根据《中华人民共和国人民检察院组织法》等相关法律规定，检察院是国家的法律监督机关，其职权主要包括对刑事诉讼、民事诉讼、行政诉讼进行法律监督，以及对司法工作人员利用职权实施的侵犯公民权利、损害司法公正的犯罪进行侦查等。虽然直接的法律条文可能并未明确提及“检查小卖部”，但检察院在履行其法律监督职责时，有权对涉及公共利益、社会秩序或可能存在违法犯罪行为的场所进行必要的调查和检查，尤其是当小卖部可能涉及销售假冒伪劣商品、非法经营等违法行为时。
二、检查的合法性与程序要求
合法性基础：检察院的检查行为必须基于合法的法律监督目的，且不得超越其法定职权范围。如果检查行为是为了调查与法律监督相关的案件或线索，且符合相关法律规定，则该检查行为是合法的。
程序要求：检察院在进行检查时，应当遵循法定程序，如出示工作证件、表明身份、说明检查目的和依据等。同时，检查过程中应当尊重被检查对象的合法权益，不得侵犯其人身自由、财产权益等。
三、可能涉及的违法情形与后果
超越职权：如果检察院的检查行为超越了其法定职权范围，或者没有合法的法律监督目的，那么该检查行为可能构成违法。此时，被检查对象有权向有关部门投诉或举报，并要求追究相关责任人员的法律责任。
程序违法：如果检察院在进行检查时未遵循法定程序，如未出示工作证件、未说明检查目的和依据等，那么该检查行为也可能构成违法。被检查对象有权拒绝不合法的检查，并可以向有关部门反映情况。
四、对小卖部的具体影响与应对建议
影响分析：对于小卖部而言，如果检察院的检查行为是合法的且符合程序要求，那么小卖部应当配合检查，如实提供相关信息和资料。如果检查发现小卖部存在违法行为，那么小卖部将面临相应的法律责任，如罚款、没收违法所得、吊销营业执照等。
应对建议：小卖部在日常经营中应当遵守相关法律法规，确保商品质量合格、经营行为合法。如果遇到检察院的检查，应当保持冷静、配合检查，并如实提供相关信息和资料。如果认为检查行为存在违法或不当之处，可以向有关部门投诉或举报，并寻求法律援助或咨询专业律师以维护自身合法权益。
总结来说，检察院对小卖部进行检查本身并不违法，但必须遵循法定程序和权限。如果小卖部对检查行为有疑问或认为存在违法之处，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。