《中华人民共和国土地管理法》对耕地保护的问题作了全面而详细的规定，主要体现在以下几个方面：
一、土地用途管制
《土地管理法》明确规定了国家实行土地用途管制制度，将土地分为农用地、建设用地和未利用地，并严格限制农用地转为建设用地，以控制建设用地总量，并对耕地实行特殊保护。这一制度确保了土地资源的合理利用和耕地的有效保护。
二、耕地总量动态平衡与占补平衡
耕地总量动态平衡：《土地管理法》要求省、自治区、直辖市人民政府应严格执行土地利用总体规划和年度土地利用计划，确保本行政区域内耕地不减少。若耕地总量减少，需由国务院责令在规定期限内组织开垦与所减少耕地的数量与质量相当的耕地。
耕地占补平衡：国家实行占用耕地补偿制度，即“占多少、垦多少”的原则。非农业建设经批准占用耕地时，占用耕地的单位需负责开垦与所占用耕地的数量和质量相当的耕地；若无条件开垦或开垦的耕地不符合要求，则需缴纳耕地开垦费，专款用于开垦新的耕地。
三、耕地保护目标责任与基本农田保护
耕地保护目标责任：各级政府应建立以基本农田保护和耕地总量动态平衡为主要内容的耕地保护目标责任制，并每年进行考核，以确保耕地保护工作的有效实施。
基本农田保护：《土地管理法》规定了国家实行基本农田保护制度，包括基本农田保护责任制度、基本农田保护区用途管制制度、占用基本农田严格审批与占补平衡制度等，以确保基本农田的数量和质量。
四、农用地转用审批与土地开发整理复垦
农用地转用审批：建设占用土地涉及农用地转为建设用地的，应办理农用地转用审批手续，并严格按照法定程序进行审批。
土地开发整理复垦：国家鼓励单位和个人按照土地利用总体规划开发未利用的土地，并优先开发成农用地。同时，鼓励土地整理，提高耕地质量，增加有效耕地面积。对于因挖损、塌陷、压占等造成土地破坏的，用地单位和个人需负责复垦或缴纳土地复垦费。
五、土地税费与法律责任
土地税费：建设占用耕地时，若无条件开垦或开垦的耕地不符合要求，需缴纳耕地开垦费；对于闲置、荒芜耕地，需缴纳闲置费；征用城市郊区菜地时，需缴纳新菜地开发建设基金等。
法律责任：《中华人民共和国刑法》对非法占用耕地改作他用、造成耕地大量毁坏的行为进行了明确规定，将依法追究刑事责任。同时，《土地管理法》也规定了相应的行政处罚措施，以确保耕地保护工作的严肃性和有效性。
综上所述，《中华人民共和国土地管理法》通过一系列制度和措施，对耕地保护进行了全面而详细的规定，旨在确保耕地的数量、质量和生态安全，为国家粮食安全提供坚实基础。