结论：供货清单和发票与合同单价不一致且高于合同单价时，是否需要补充协议取决于双方的具体约定和实际履行情况。以下从不同角度进行分析：

一、合同约定明确，且双方无异议

1. 情况说明：如果合同中明确约定了货物的单价，且双方在实际履行过程中，虽然供货清单和发票上的单价高于合同单价，但双方对此均无异议，且买方已经按照供货清单和发票上的金额支付了货款，卖方也接受了该款项，那么可以视为双方对合同单价进行了实际变更。
2. 法律建议：在此情况下，虽然未签订书面补充协议，但双方的实际行为已经构成了对原合同的变更。不过，为了规避潜在的法律风险，建议双方还是签订一份书面补充协议，明确变更后的单价及双方的权利义务，以确保合同的严谨性和合法性。

二、合同约定明确，但双方有异议

1. 情况说明：如果合同中明确约定了货物的单价，但供货清单和发票上的单价高于合同单价，且买方对此提出异议，认为卖方擅自提高了单价，那么双方就存在合同纠纷。
2. 法律建议：
   • 协商：双方应首先尝试通过协商解决纠纷，看是否能够达成一致意见，如调整单价或签订补充协议等。
   • 诉讼或仲裁：如果协商不成，买方可以依据合同中的争议解决条款，向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，要求卖方按照合同约定的单价履行合同义务，或者要求卖方承担违约责任。

三、合同未明确约定单价或约定不明确

1. 情况说明：如果合同中未明确约定货物的单价，或者约定的单价不明确，那么供货清单和发票上的单价就可以作为双方结算的依据。但在此情况下，如果买方认为供货清单和发票上的单价过高，也可以提出异议。
2. 法律建议：
   • 补充协议：为了避免纠纷，双方可以签订一份补充协议，明确货物的单价及双方的权利义务。
   • 参考市场价格：如果双方无法就单价达成一致意见，可以参考市场价格或行业惯例来确定单价。如果仍然无法达成一致，那么可能需要通过诉讼或仲裁来解决纠纷。

四、税务及发票方面的考虑

1. 情况说明：从税务和发票的角度来看，供货清单和发票上的单价应当与实际交易价格一致。如果供货清单和发票上的单价高于合同单价，且未经过双方协商一致，那么可能存在虚开发票的风险。
2. 法律建议：
   • 合规性：卖方应确保供货清单和发票上的单价与实际交易价格一致，以避免虚开发票等违法行为。
   • 税务申报：买方在申报税务时，也应按照实际交易价格进行申报，以避免税务风险。

总结与进一步行动建议：供货清单和发票与合同单价不一致时，是否需要补充协议取决于双方的具体约定和实际履行情况。为了避免潜在的法律风险和税务风险，建议双方在发现不一致时及时沟通协商，并根据实际情况签订补充协议或采取其他合法措施。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。