若在行政赔偿诉讼中发现被告存在关系案（即可能存在不正当干预或利益关联影响案件公正审理的情况），您可通过以下途径维护合法权益：

1. 申请回避
   根据《行政诉讼法》第四十七条，若您认为审判人员、书记员、翻译人员、鉴定人或勘验人与本案存在利害关系或其他可能影响公正审理的关系，有权在案件开始审理时或法庭辩论终结前申请其回避。申请需明确说明回避理由及证据（如关联关系证明、利益输送线索等），法院应在3日内作出决定并通知申请人。若申请被驳回，您可申请复议一次。

2. 向法院监察部门或上级法院反映
   若发现被告通过不正当手段干预案件（如贿赂、威胁、利用职权施压等），可向受理案件法院的监察部门或其上级法院提交书面举报材料，附上证据（如录音、聊天记录、书面文件等）。法院监察部门需依《人民法院监察工作条例》调查处理，若查实存在违法违纪行为，相关人员可能面临纪律处分或刑事追责，案件可能被指定其他法院重新审理。

3. 申请异地管辖或指定管辖
   若关系案导致本地法院难以公正审理，您可在答辩期内向法院提交《管辖权异议申请书》，请求将案件移送至无利害关系的其他法院审理。需说明本地法院存在影响公正审理的具体情形（如被告与法院领导存在亲属关系、被告单位长期为法院提供赞助等）。若法院驳回申请，您可上诉至上一级法院，由其裁定是否变更管辖。

4. 通过信访渠道监督
   若上述途径未获有效回应，您可向同级或上级政法委、信访部门提交书面材料，反映案件中存在的干预司法问题。需注意信访材料需客观、具体，避免情绪化表述，并附上已提交的回避申请、管辖异议申请等证据。政法委可能协调多部门介入调查，推动案件公正处理。

关键提醒：

• 证据收集是核心，需保留所有能证明关系案存在的材料（如书面文件、电子数据、证人证言等）；
  
• 行动需在法定时限内完成（如回避申请需在法庭辩论终结前提出）；
  
• 若案件已进入审理阶段，避免直接与被告或其代理人发生冲突，所有沟通通过法院进行。
  

若您需进一步分析具体证据效力或制定诉讼策略，可直接向我提供案件细节，我将结合《行政诉讼法》及相关司法解释为您详细解答。