在仅起诉分公司的情况下，后续是否可以执行总公司，需视具体情况而定，但通常存在可以执行总公司的可能性。以下从不同角度进行分析：
一、法律关系角度
分公司作为总公司的分支机构，虽然具有相对独立的民事主体资格，但其民事责任最终由总公司承担。根据《中华人民共和国公司法》第十四条：“公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。”这一规定明确了分公司与总公司之间的法律关系，即分公司是总公司的组成部分，其民事责任最终归属于总公司。
二、诉讼执行角度
直接执行总公司：
- 在诉讼过程中，如果仅起诉分公司并获得胜诉判决，但分公司财产不足以清偿债务时，根据法律规定，可以追加总公司为被执行人，直接执行总公司的财产。这是因为分公司的民事责任最终由总公司承担，所以执行总公司财产是合法的。
诉讼中追加总公司为被告：
- 在诉讼过程中，如果发现分公司财产不足以清偿债务，或者为了更全面地保障债权人的权益，可以在诉讼中直接追加总公司为共同被告。这样，在判决生效后，可以直接执行总公司和分公司的财产，无需再通过追加被执行人的程序。
执行阶段追加总公司为被执行人：
- 如果在诉讼阶段仅起诉了分公司，并获得了胜诉判决，但在执行阶段发现分公司财产不足以清偿债务，此时可以向法院申请追加总公司为被执行人。法院在审查后，如果认为符合法律规定，会裁定追加总公司为被执行人，并执行其财产。
三、实际操作建议
充分了解分公司与总公司的财产状况：
- 在起诉前或诉讼过程中，应尽可能了解分公司与总公司的财产状况，以便在需要时能够及时追加总公司为被告或被执行人。
及时申请追加：
- 如果在执行阶段发现分公司财产不足以清偿债务，应及时向法院申请追加总公司为被执行人，以免错过执行时机。
保留相关证据：
- 在诉讼和执行过程中，应保留好与分公司和总公司相关的证据材料，如合同、发票、转账记录等，以便在需要时能够证明分公司与总公司之间的法律关系和债务承担情况。
总结来说，仅起诉分公司并不意味着无法执行总公司。在分公司财产不足以清偿债务的情况下，可以通过法律程序追加总公司为被执行人，并执行其财产。因此，在涉及分公司与总公司的法律纠纷时，应充分了解相关法律规定和实际操作流程，以便更好地维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。