领导要求下属必须拿工程回扣款的行为是严重违法的，下属不应屈从，且应采取合法措施保护自己。以下从不同角度详细分析：

从法律责任角度

1. 领导层面：领导要求下属拿工程回扣款，这属于索贿行为。根据《中华人民共和国刑法》第三百八十五条，国家工作人员利用职务上的便利，索取他人财物的，或者非法收受他人财物，为他人谋取利益的，是受贿罪。即使领导不是国家工作人员，若其所在单位属于公司、企业等经济组织，领导利用职务便利索取回扣，数额较大的，也可能构成非国家工作人员受贿罪，依据《中华人民共和国刑法》第一百六十三条，公司、企业或者其他单位的工作人员利用职务上的便利，索取他人财物或者非法收受他人财物，为他人谋取利益，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
2. 下属层面：如果下属按照领导要求拿了工程回扣款，可能构成受贿罪的共犯。根据《中华人民共和国刑法》第二十五条，共同犯罪是指二人以上共同故意犯罪。下属明知领导索取回扣是违法犯罪行为，仍参与其中，与领导构成共同犯罪，需要承担相应的刑事责任。即使下属是被胁迫参与，根据《中华人民共和国刑法》第二十八条，对于被胁迫参加犯罪的，应当按照他的犯罪情节减轻处罚或者免除处罚，但这并不意味着下属可以完全免责，依然可能面临法律的制裁。

从应对措施角度

1. 坚决拒绝：下属应明确向领导表明自己不会参与这种违法犯罪行为，强调这种行为的违法性和严重后果，如可能面临的刑事处罚、对个人声誉和职业生涯的毁灭性打击等。例如，可以诚恳地对领导说：“领导，我知道您可能是出于一些考虑提出这样的要求，但拿工程回扣款是违法的，一旦被发现，我们都会受到法律的严惩，这不仅会毁了我们自己，也会给公司带来巨大的损失，所以我不能答应您。”
2. 保留证据：如果领导继续施压，下属应尽可能保留相关证据，如领导的书面指示、聊天记录、通话录音等。这些证据在后续可能涉及的调查或法律程序中至关重要，能够证明下属是受到领导的胁迫或指示，并非主动参与违法犯罪行为。例如，将领导的微信聊天记录进行截图保存，或者对与领导的通话进行录音（需注意在合法合规的前提下进行录音）。
3. 向相关部门举报：下属可以向公司内部的监察部门、审计部门举报领导的违法行为，也可以向公安机关、检察机关等司法机关报案。在举报时，应提供详细的证据和信息，以便相关部门能够及时展开调查。例如，向公司监察部门提交书面举报材料，详细说明领导要求拿回扣款的时间、地点、方式等情况，并附上相关证据；或者向公安机关报案，按照公安机关的要求配合调查。
4. 寻求法律保护：如果下属因为拒绝拿回扣款而遭到领导的打击报复，如降职、降薪、解雇等，下属可以依据《中华人民共和国劳动法》《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，维护自己的合法权益。例如，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司恢复原工作岗位、补发工资等；如果对仲裁结果不满意，还可以向人民法院提起诉讼。

总之，面对领导要求拿工程回扣款的情况，下属一定要保持清醒的头脑，坚守法律底线，采取合法有效的措施保护自己。如果你还有其他关于职场法律方面的问题，可以直接向我咨询。