结论：在行政诉讼中，若一审不立案而二审立案后将案卷发回一审，当事人一般不能再就同一事实和理由重新起诉，但存在例外情况。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况：不能再起诉
法律依据：
- 根据《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释，行政诉讼遵循“一事不再理”原则。即，对于已经经过法院审理并作出裁判的案件，当事人不得就同一事实和理由再次向法院提起诉讼。
逻辑分析：
- 在一审不立案的情况下，若二审法院认为一审法院不立案的理由不成立，并裁定发回一审法院重新审理，这实际上是对原案件的继续审理，而非一个新的诉讼程序。
- 因此，当二审法院将案卷发回一审法院后，一审法院应当继续审理该案件，并作出裁判。当事人应当等待一审法院的裁判结果，而不是就同一事实和理由重新起诉。
二、例外情况：可以重新起诉
法律依据与例外情形：
- 虽然“一事不再理”原则是行政诉讼的一般原则，但也存在例外情况。例如，如果一审法院在发回重审后，仍然不立案或者作出错误的裁判，且当事人有新的证据或理由足以推翻原裁判的，当事人可以在法定期限内向上一级法院提起上诉或申请再审。
- 此外，如果二审法院在发回重审时，明确指出了原案件存在的问题或需要进一步查清的事实，而一审法院在重新审理过程中未能正确处理这些问题或事实，导致案件再次出现错误裁判的，当事人也可以考虑通过其他法律途径寻求救济。但这种情况并不等同于就同一事实和理由重新起诉。
实际操作建议：
- 在实际操作中，如果当事人认为一审法院在发回重审后仍然存在不立案或错误裁判的情况，应当及时向二审法院或上级法院反映情况，并寻求法律援助或咨询专业律师的意见。
- 当事人也可以考虑通过申请再审或提起上诉等法律途径来维护自己的合法权益，但需要确保有充分的证据和理由来支持自己的主张。
三、特殊情况下的处理
- 如果当事人认为一审法院的不立案决定或二审法院的发回重审裁定存在错误，且该错误影响了当事人的合法权益，当事人还可以考虑通过向检察机关申请监督或向纪检监察机关举报等方式来寻求救济。但这些方式并不等同于重新起诉，而是对原诉讼程序或裁判结果的监督或纠正。
建议：在行政诉讼中，若遇到一审不立案而二审立案后将案卷发回一审的情况，当事人应当耐心等待一审法院的重新审理结果，并积极配合法院的审理工作。如果认为一审法院的审理结果存在错误或不当之处，应当及时通过合法途径寻求救济。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。