结论：在房子卖了都不够还房贷，但银行已同意的情况下，银行通常不会继续扣留房产证，但具体还需根据银行与借款人之间的协议以及相关法律法规来确定。
分析说明：
银行同意后的处理：
- 当房屋出售所得不足以偿还全部房贷时，若银行已经同意了借款人的还款方案（可能是部分还款、延期还款或其他安排），这通常意味着银行已经接受了当前的处理方式，并会按照双方达成的协议来执行。
- 在这种情况下，银行继续扣留房产证的可能性较小，因为房产证作为房屋所有权的法律证明，其扣留通常是为了保障银行的债权。既然银行已经同意了还款方案，那么扣留房产证的目的已经达成或不再必要。
协议内容的重要性：
- 银行与借款人之间的协议是确定双方权利和义务的关键。如果协议中明确规定了房产证的处理方式（如归还借款人、继续由银行保管等），则应按照协议执行。
- 若协议中未明确提及房产证的处理，但银行已经表示同意借款人的还款方案，那么借款人可以与银行进一步沟通，明确房产证的归还事宜。
法律法规的考量：
- 根据相关法律法规，银行在贷款过程中有权要求借款人提供担保，并可以依法扣留担保物的相关证件（如房产证）。然而，在借款人已经履行或部分履行还款义务，且银行已经同意还款方案的情况下，银行继续扣留房产证可能缺乏法律依据。
- 如果银行无正当理由继续扣留房产证，借款人可以通过法律途径维护自己的合法权益，如向法院提起诉讼要求银行归还房产证。
后续行动建议：
- 与银行沟通：首先，借款人应与银行进一步沟通，明确房产证的处理方式，并确保双方对还款方案和房产证归还事宜达成一致。
- 保留相关证据：借款人应保留好与银行沟通的记录、还款凭证等相关证据，以备不时之需。
- 咨询专业律师：如果借款人对银行的处理方式存在疑问或担忧，可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的维权途径。
特殊场景提醒：
- 如果银行在同意还款方案的同时，要求借款人提供其他担保或条件（如增加担保人、提供其他资产作为抵押等），借款人应仔细阅读协议条款，确保自己能够履行这些条件，并了解这些条件对房产证处理的影响。
- 如果借款人因特殊原因（如疾病、失业等）导致无法按时还款，且已经与银行沟通并获得了银行的谅解和同意，那么借款人应确保按照新的还款方案履行义务，以避免因违约而导致银行采取更严厉的措施（如继续扣留房产证、提起诉讼等）。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。