工伤认定时只提供了部分病历，认定结果是否合法需分情况讨论：

1. 若提供的部分病历足以证明工伤事实：

   • 根据《工伤保险条例》及相关规定，工伤认定的核心在于确认职工因工作遭受事故伤害或患职业病的事实。若提供的部分病历已经能够清晰、充分地证明这一事实，比如病历中明确记载了受伤时间、地点、原因以及伤情等关键信息，且这些信息与工伤认定申请中的描述一致，那么即使未提供全部病历，工伤认定部门依然可以依法作出认定决定，此时认定结果是合法的。

2. 若提供的部分病历不足以证明工伤事实：

   • 如果仅提供的部分病历内容模糊、信息不完整，或者无法直接证明工伤事实，比如病历中缺少受伤时间、地点或原因等关键信息，或者这些信息与工伤认定申请中的描述存在矛盾，那么工伤认定部门可能会要求补充更多病历资料或其他证据材料。在这种情况下，如果未补充足够证据，仅凭部分病历作出的工伤认定决定可能是不合法的，因为它可能无法准确反映工伤事实，损害了当事人的合法权益。

法律建议：

• 对于职工而言：在申请工伤认定时，应尽可能提供完整、详细的病历资料，包括门诊病历、住院病历、诊断证明、检查报告等，以充分证明工伤事实。如果因特殊原因无法提供全部病历，也应向工伤认定部门说明情况，并积极配合补充其他证据材料。
• 对于用人单位而言：应积极协助职工办理工伤认定手续，提供必要的支持和帮助。如果认为职工提供的病历资料不完整或存在疑问，可以及时向工伤认定部门提出异议，并要求补充证据或进行进一步调查。

可能后果：

• 如果工伤认定决定因病历资料不完整而被撤销或变更，职工可能无法及时获得工伤保险待遇，影响其合法权益。
• 用人单位如果未依法协助职工办理工伤认定手续或提供虚假证据，可能面临行政处罚或法律责任。

总结：工伤认定时只提供部分病历，认定结果是否合法取决于这些病历是否足以证明工伤事实。因此，在申请工伤认定时，应尽可能提供完整、详细的病历资料，以确保认定结果的合法性和准确性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。