公司制度是否适用全体员工，包括劳务关系的员工，这主要取决于公司制度的具体内容以及劳务关系员工与公司之间的约定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 公司制度的内容与性质：

   • 公司制度通常是为了规范公司内部管理、保障公司运营秩序而制定的，它可能涉及员工的行为规范、考勤管理、薪酬福利、保密义务等多个方面。
   • 如果公司制度中明确规定了其适用范围包括所有与公司建立劳动关系或劳务关系的员工，那么该制度自然对劳务关系员工也具有约束力。

2. 劳务关系与劳动关系的区别：

   • 劳动关系是指用人单位与劳动者之间，依据劳动法律规范，签订劳动合同，劳动者接受用人单位的管理，从事用人单位安排的工作，成为用人单位的成员，从用人单位领取报酬和受劳动保护所产生的法律关系。
   • 劳务关系则是指两个或两个以上的平等主体之间，依据民事法律规范，一方向另一方提供劳务，另一方接受劳务并支付对价的法律关系。劳务关系员工通常不享受与劳动关系员工相同的福利待遇和劳动保护。

3. 公司制度对劳务关系员工的适用性：

   • 如果公司制度中未明确排除劳务关系员工，且该制度的内容不违反法律法规的强制性规定，也不损害劳务关系员工的合法权益，那么该制度在理论上是可以适用于劳务关系员工的。
   • 然而，在实际操作中，由于劳务关系员工与公司在法律地位上相对平等，且通常不享受与劳动关系员工相同的福利待遇，因此公司制度对劳务关系员工的约束力可能相对较弱。如果公司制度对劳务关系员工设置了过于苛刻或不合理的条款，可能会引发争议或纠纷。

4. 约定优先原则：

   • 在劳务关系中，双方的权利和义务通常通过劳务合同来约定。如果劳务合同中明确规定了公司制度对劳务关系员工的适用性，或者双方在公司制度适用方面达成了其他约定，那么这些约定将优先于公司制度的一般规定。

建议：

• 对于公司而言，在制定公司制度时，应明确其适用范围，并考虑劳务关系员工的特殊情况，避免设置过于苛刻或不合理的条款。
• 对于劳务关系员工而言，在签订劳务合同时，应仔细阅读合同条款，了解公司制度对自己的适用性，并在必要时与公司进行协商或寻求法律帮助。

可能的法律后果：

• 如果公司制度违反了法律法规的强制性规定或损害了劳务关系员工的合法权益，劳务关系员工有权向相关部门投诉或寻求法律救济。
• 如果公司制度对劳务关系员工设置了过于苛刻或不合理的条款，并因此引发争议或纠纷，公司可能需要承担相应的法律责任。

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