结论前置：购买车辆时发票由另外的销售公司开具是否合法，需分情况讨论，具体如下：
若存在真实交易背景且符合税务规定
若车辆实际销售方与开票方存在合法关联关系（例如：开票方为销售方的分公司、子公司或授权委托开票方），且交易真实发生、资金流与物流一致、税款正常缴纳，则该行为合法。
法律依据：根据《发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务的单位和个人，对外发生经营业务收取款项时，收款方应向付款方开具发票。若开票方与实际交易方存在合法代理或关联关系，且符合税务机关的备案要求，则不违反规定。
实务建议：需保留以下证据：
- 销售方与开票方的关联关系证明（如工商登记、授权委托书）；
- 完整的交易合同、付款凭证、物流单据；
- 税务机关出具的合规性证明（如代开发票备案记录）。
若不存在真实交易背景或存在“虚开发票”行为
若开票方与实际销售方无关联，或交易未真实发生（如：车辆未交付、款项未支付），仅通过“过票”形式开具发票，则涉嫌虚开发票，属于违法行为。
法律后果：
- 根据《刑法》第二百零五条，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，可能面临三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；虚开税款数额较大或情节严重的，刑期可升至三年以上十年以下，并处罚金。
- 根据《税收征收管理法》第六十三条，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁账簿、记账凭证，或在账簿上多列支出或不列、少列收入，或经税务机关通知申报而拒不申报或进行虚假的纳税申报，不缴或少缴应纳税款的，是偷税行为，税务机关将追缴税款、加收滞纳金，并处不缴或少缴税款百分之五十以上五倍以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
实务建议：若发现此类情况，应立即停止交易，并向税务机关举报，同时保留相关证据（如聊天记录、转账记录、合同等）以自证清白。
特殊情形：委托代开发票
若销售方因客观原因（如无开票资质）委托第三方代开发票，且符合以下条件，则合法：
- 代开方为税务机关或其授权的机构；
- 交易真实发生且税款已缴纳；
- 代开申请已获税务机关批准。
法律依据：根据《发票管理办法》第十六条，需要临时使用发票的单位和个人，可凭购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动的书面证明、经办人身份证明，直接向经营地税务机关申请代开发票。
总结：发票由其他公司开具是否合法，关键在于交易真实性、开票方资质及税务合规性。建议购车时核实开票方与销售方的关系，要求提供完整交易证据，并避免接受无真实交易背景的发票。若对具体操作有疑问，可直接向我咨询。