结论：将宅基地登记在母亲名下，而母亲已有一处宅基地，这一行为是否合法，需分情况讨论，一般情况下不合法，但存在特殊情况可能合法。

一、一般情况下不合法

根据《土地管理法》的相关规定，农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。这一规定旨在保护农村土地资源，防止土地浪费和滥用。因此，在母亲已经拥有一处宅基地的情况下，若再将儿子的宅基地登记在母亲名下，就违反了“一户一宅”的原则，属于不合法行为。

二、特殊情况下可能合法

尽管一般情况下“一户一宅”是原则，但也存在一些特殊情况，使得将宅基地登记在已有宅基地的母亲名下可能合法。这些特殊情况主要包括：

1. 继承原因：如果母亲原有的宅基地是通过继承方式获得的，且继承后并未超过当地规定的宅基地面积标准，那么在这种情况下，母亲可能仍然有权拥有另一处宅基地（即儿子原本的宅基地，若儿子同意由母亲继承或登记在其名下）。但这种情况较为特殊，且需要满足严格的法律条件。

2. 政策允许：在某些地区，由于历史原因或特殊政策，可能存在“一户多宅”的合法情况。例如，某些地区可能允许因分家、离婚等原因而形成的“一户多宅”现象。但这种情况需要具体了解当地的政策规定，并确认是否适用于母亲和儿子的情况。

3. 宅基地使用权转让：如果儿子原本拥有的宅基地使用权是通过合法方式（如购买、赠与等）从他人处获得的，且转让行为符合当地宅基地使用权转让的相关规定，那么在这种情况下，若儿子同意将宅基地登记在母亲名下，且母亲符合宅基地使用权人的条件（如农村集体经济组织成员身份等），则可能合法。但这种情况同样需要满足严格的法律条件。

三、法律建议

1. 了解当地政策：在考虑将宅基地登记在母亲名下之前，建议先了解当地关于宅基地使用的具体政策规定，以确认是否允许“一户多宅”或存在其他特殊情况。

2. 咨询相关部门：如果对当地政策不了解或存在疑问，建议咨询当地土地管理部门或农村集体经济组织等相关部门，以获取更准确的法律意见。

3. 谨慎处理：在处理宅基地问题时，务必谨慎行事，避免违反法律法规或损害他人利益。如果涉及复杂的法律问题或纠纷，建议寻求专业律师的帮助。

有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，给出更详细的法律建议。