在行政诉讼中，同一案件确实可以存在多个被告单位。这一结论主要基于以下法律分析和实际应用考量：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国行政诉讼法》第二十六条的规定，若两个以上行政机关共同作出同一行政行为，原告在提起行政诉讼时，可以将这些共同作出行政行为的行政机关列为共同被告。这一条款为行政诉讼中多个被告单位的存在提供了明确的法律依据。

2. 共同被告的情形：

   • 共同作出行政行为：当两个或两个以上的行政机关共同参与并作出一个具体的行政行为时，这些行政机关将作为共同被告。例如，在联合执法过程中，不同部门共同对某一违法行为进行了处罚，若相对人对此处罚决定不服提起行政诉讼，则所有参与联合执法的部门均需作为共同被告出庭应诉。
   • 经上级批准的行政行为：若一个行政行为是由一个行政机关作出，但经过了上级行政机关的批准，那么在提起行政诉讼时，原告可以将作出行政行为的行政机关和批准该行政行为的上级行政机关列为共同被告。不过，若原告仅起诉作出行政行为的行政机关或批准机关，法院应告知原告追加另一机关为共同被告，若原告不同意，则法院应通知另一机关作为第三人参加诉讼。

3. 实际应用中的注意事项：

   • 明确被告身份：在提起行政诉讼前，原告需要仔细审查并确定所有共同作出行政行为的行政机关，以确保诉讼的有效性和针对性。若被告身份确定错误或遗漏，可能导致诉讼被驳回或无法得到有效救济。
   • 全面收集证据：为了证明多个行政机关共同作出了被诉行政行为，原告需要全面收集相关证据，如联合执法的文件、会议记录、行政处罚决定书等。这些证据将有助于在诉讼中充分举证并说服法院。
   • 合理组织诉讼策略：面对多个被告的情况，原告需要合理组织诉讼策略，明确诉讼请求和法律依据。例如，可以针对不同被告的行政行为分别提出诉讼请求，或者要求所有被告共同承担责任。

4. 法律后果：

   • 若法院认定多个被告单位共同作出了被诉行政行为，且该行政行为违法或不当，则所有被告单位可能需要共同承担相应的法律责任。这包括撤销或变更行政行为、赔偿损失等。

举例说明： 假设某市环保局和城管局联合对一家工厂进行了环保检查，并共同作出了罚款决定。若该工厂对此罚款决定不服提起行政诉讼，则可以将市环保局和城管局列为共同被告。在诉讼过程中，工厂需要提供证据证明两个部门共同参与了检查并作出了罚款决定。若法院认定该罚款决定违法或不当，则市环保局和城管局可能需要共同承担撤销罚款决定、赔偿工厂损失等法律责任。

综上所述，行政诉讼中同一案件可以存在多个被告单位。在实际操作中，原告需要充分了解相关法律法规和诉讼程序，确保在提起诉讼前能够准确确定被告的身份和数量，为后续的诉讼过程奠定坚实的基础。若您在行政诉讼中遇到类似问题或有其他法律疑问，可以直接向我咨询。