结论：签订服务合同后，因时间关系不能在年内完成，专项经费能否支出需视合同具体条款、履行情况及双方协商结果而定。以下从不同角度进行分析：

一、合同条款的约定

1. 合同有明确约定：

   • 如果服务合同中明确规定了服务完成的时间节点，并且约定了因时间延误导致的经费处理方式（如延期支付、部分支付或全额支付等），则应按照合同约定执行。
   • 例如，合同可能规定：“若因乙方原因导致服务未能在约定时间内完成，乙方应承担相应责任，且专项经费的支付将根据实际完成情况进行调整。”在此情况下，若因时间关系不能在年内完成，专项经费的支出将受到合同条款的严格约束。

2. 合同无明确约定：

   • 如果服务合同中没有明确约定服务完成的时间节点或经费处理方式，则双方应依据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规进行协商。
   • 在此情况下，专项经费的支出将更多地取决于双方的协商结果和实际履行情况。

二、实际履行情况

1. 服务已部分完成：

   • 如果服务已经部分完成，且部分完成的服务符合合同约定的质量标准，那么根据公平原则，专项经费中对应已完成部分的服务费用应当支付。
   • 例如，若合同总金额为100万元，服务已完成了50%，且已完成部分符合合同要求，则理论上应支付50万元的专项经费。

2. 服务未开始或仅少量完成：

   • 如果服务尚未开始或仅完成了少量工作，且因时间关系无法在年内完成，那么专项经费的支出将受到更大限制。
   • 在此情况下，双方可能需要重新协商合同条款，包括服务完成时间、经费支付方式等，以达成新的共识。

三、双方协商结果

1. 达成一致意见：

   • 无论合同条款如何约定，双方都可以通过协商达成一致意见，对专项经费的支出进行灵活调整。
   • 例如，双方可能同意延期支付专项经费，或者根据实际完成情况调整支付比例等。

2. 无法达成一致意见：

   • 如果双方无法就专项经费的支出达成一致意见，则可能引发合同纠纷。
   • 在此情况下，任何一方都可以依法向人民法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。

四、法律建议

1. 审查合同条款：

   • 在签订服务合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于服务完成时间、经费支付方式等关键条款，确保合同条款明确、具体、可执行。

2. 及时沟通协商：

   • 在服务过程中，如因时间关系无法按时完成服务，应及时与对方沟通协商，寻求解决方案，避免引发不必要的合同纠纷。

3. 保留相关证据：

   • 在服务过程中，应保留好相关证据，如工作记录、沟通记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。

如有更多关于合同纠纷的具体问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。