结论前置：中秋节当天（农历中秋当日）上班，劳动者应获得的三倍工资是在原有工资基础上的额外支付，不会扣除原有的底薪；而若是在中秋节的调休日工作且不能安排补休，则应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬，同样不会扣除原有底薪。
详细分析如下：
法定节假日加班费计算：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，法定休假日安排劳动者工作的，用人单位必须支付不低于工资的百分之三百的工资报酬作为加班费。中秋节属于全体公民放假的节日，且明确规定放假1天（农历中秋当日）。因此，如果劳动者在这一天被安排工作，其加班工资应按照不低于其本人日或小时工资的300%来计算。
- 举例说明：假设劳动者的日工资为200元，那么中秋节当天加班，其应获得的加班费至少为600元（200元×300%），这600元是在原有工资基础上的额外支付，不会扣除原有的底薪。
调休日加班费计算：
- 如果中秋节的假期被调整至其他日期，如通过调休安排在中秋前后的周末，那么这一天就变为普通的休息日。此时若安排劳动者工作，按照法律规定，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬作为加班费。
- 举例说明：同样假设劳动者的日工资为200元，那么在调休日加班，其应获得的加班费至少为400元（200元×200%），这400元同样是在原有工资基础上的额外支付，不会扣除原有底薪。
单位内部规定的影响：
- 除了上述法律规定的加班费标准外，实际到手的加班费还可能受到单位内部规定的影响。比如有的单位可能会提供额外的节日福利或加班补贴。因此，劳动者在查看单位的具体规定或咨询人事部门的同时，也参考下员工手册，以确保自己对加班费有准确的了解与期待。
法律建议：
- 劳动者在中秋节期间若被安排加班，应主动了解单位的加班费政策，确保自己的合法权益得到妥善保护。
- 如果用人单位未按照法律规定支付加班费，劳动者可以与用人单位协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果用人单位未按照法律规定支付加班费，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付加班费、加付赔偿金等。
- 劳动者也有权因此解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿金。
综上所述，中秋节当天加班应获得的三倍工资是在原有工资基础上的额外支付，不会扣除原有的底薪；调休日加班则应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬，同样不会扣除原有底薪。劳动者应主动了解单位政策，确保自己的合法权益得到保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。