员工在老板不干了的情况下自己扣钱，通常是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：
法律原则层面
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这一条款明确规定了用人单位不得随意扣除劳动者的工资，除非存在法定或约定的扣款情形。因此，员工在老板不干了的情况下，自己扣钱并不符合这一法律原则。
可能合法的扣款情形（但需注意主体）
尽管一般情况下不得随意扣工资，但在以下特定情形下，用人单位可以依法扣除部分工资（注意是用人单位，而非员工自己）：
- 代扣代缴个人所得税：用人单位需按照法律规定代扣代缴员工的个人所得税。
- 代扣代缴应由劳动者个人负担的各项社会保险费用：如养老保险、医疗保险等。
- 法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费：如果员工需要支付这些费用，且法院有相关判决或裁定，用人单位可以代扣。
- 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的赔偿：但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 违反公司规章制度或劳动合同的约定：例如，迟到、早退、旷工、未完成工作任务等，但必须有明确的制度规定和合同约定，并且扣款金额应合理。
- 事假未提供劳动期间：员工请事假期间，用人单位可以不支付工资，但这不属于“克扣”，而是基于未提供劳动的正当理由。
重要说明：上述扣款情形的主体均为用人单位，而非员工自己。员工自己扣钱并不符合这些法定或约定的扣款情形。
不合理扣款的情形及应对措施
不合理扣款的情形：
- 试用期随意扣工资：试用期是双方相互考察的时期，用人单位不能随意以试用不合格为由扣工资。
- 辞职扣工资：员工正常辞职时，用人单位应结清工资，不得以任何理由扣押。
- 因不可抗力或其他非劳动者原因导致的损失而扣工资：如自然灾害、政策调整等，这些不应由劳动者承担。
- 老板不干了，员工自己扣钱：这种情形同样属于不合理扣款，因为员工没有法律依据来扣除自己的工资。
应对措施：
- 与用人单位协商（如果老板不干了但公司仍有其他负责人或接管者）：首先尝试与用人单位沟通，了解扣款的具体原因和依据，争取协商解决。但在此案例中，由于老板不干了，这一步骤可能难以实施。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，或者无法联系到用人单位的相关负责人，可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁：对于劳动监察部门的处理结果不满意，或者用人单位拒不执行处理决定的，可以申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的权益。
特殊情况说明
如果老板不干了，且公司无法继续运营，员工应关注的是如何维护自己的合法权益，如要求结清工资、经济补偿等，而不是自己扣钱。自己扣钱不仅无法解决问题，还可能引发新的法律纠纷。
总结与建议：员工在老板不干了的情况下自己扣钱是不合法的。如果遇到这种情况，建议员工及时与用人单位沟通（如果可能的话），或者向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。如果你有更多关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。