员工自己离职公司扣钱是否合法，主要取决于扣钱的理由和方式是否符合法律法规。 以下从多个角度进行详细分析：
一、不合法的情况
随意克扣工资：
- 根据《工资支付暂行规定》及《中华人民共和国劳动法》，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。如果公司仅仅因为员工辞职就扣钱，没有合理依据和法律规定，这种做法是违法的。例如，员工按照正常流程提前通知公司辞职，公司却无故扣除员工当月工资的一定比例，这侵犯了员工获得劳动报酬的权利。
违法设定违约金：
- 根据《劳动合同法》，除两种法定情形外（即用人单位提供专项培训并约定服务期、保密及竞业限制），用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。如果公司在不符合上述法定情形下，因员工辞职而扣钱作为违约金，是不合法的。
以不合理理由扣款：
- 公司不能以诸如员工离职影响团队士气、未完成所谓的“交接指标”等不合理理由进行扣款。这些理由缺乏法律依据，且侵犯了员工的合法权益。
二、合法的情况
员工违反服务期约定：
- 当用人单位为劳动者提供专项培训费用，并进行专业技术培训，同时与劳动者约定了服务期时，若劳动者在服务期未满时辞职，用人单位可以要求劳动者按约定支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
违反竞业限制约定：
- 若员工与公司签订了竞业限制协议，在离职后违反该约定，到与原单位有竞争关系的其他单位工作或自己开业从事同类业务，公司有权要求员工支付违约金。
员工给公司造成经济损失：
- 如果员工在辞职过程中，因故意或重大过失给用人单位造成经济损失，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿可从员工工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。例如，仓库管理员因疏忽导致货物损坏，公司可按规定从其工资中扣除相应的赔偿款。
公司有明确的规章制度：
- 如果公司有经过民主程序制定并向员工公示的明确规章制度，规定在员工辞职时可扣除一定款项，且扣除方式符合法律法规（如扣除未归还的办公用品费用、未结清的借款等），那么这种扣除可能是合法的。
三、员工权益保护建议
- 了解公司规章制度：在离职前，员工应仔细阅读公司的规章制度，了解其中关于离职扣款的规定，确保自己的权益不受侵害。
- 保留相关证据：如公司扣款，员工应保留好工资条、扣款通知等相关证据，以便在需要时维护自己的权益。
- 与公司协商：如果公司扣款理由不合理或扣款金额过高，员工可以尝试与公司协商解决，要求返还被扣款项。
- 寻求法律援助：如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁、向法院提起诉讼，要求公司支付被扣除的工资及相应的赔偿。
总结来说，员工自己离职公司扣钱是否合法，需根据具体情况判断。 员工应了解自己的合法权益，并在遇到不法行为时及时采取措施维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。