厢式货车开顶被交警查处，一般会被认定为“擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据”的违法行为，依据《道路交通安全法》及相关规定，通常面临罚款处罚，并可能被责令恢复原状。具体处理方式及法律分析如下：

1. 违法行为认定
   厢式货车的设计结构中，车厢顶部属于车辆登记的技术参数范围。若车主未经车管部门审批，擅自拆除或改装车厢顶部（如开顶、加装可拆卸顶棚等），即构成“擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据”的违法行为。此行为违反《道路交通安全法》第十六条第一项：“任何单位或者个人不得拼装机动车或者擅自改变机动车已登记的结构、构造或者特征”。

2. 处罚措施

   • 罚款：根据《机动车登记规定》第七十九条，此类违法行为可由公安机关交通管理部门处警告或500元以下罚款。实践中，罚款金额通常根据违法情节（如改装程度、是否影响安全等）在200-500元区间浮动。
     
   • 责令恢复原状：交警会要求车主在规定期限内将车辆恢复至登记时的原始状态（如重新安装车厢顶棚），并可能要求提供改装前的照片或车辆登记证书作为恢复依据。若未按时整改，可能面临进一步处罚或车辆扣留。

3. 特殊情形说明

   • 临时开顶的合法性：若因装卸货物需要临时打开顶棚（如使用可拆卸顶棚的厢式货车），需确保：
     
     • 车辆登记时已备案该设计（如登记为“可开启顶棚式货车”）；
       
     • 行驶过程中顶棚处于闭合状态，仅在装卸时开启；
       
     • 未改变车辆整体结构（如未拆除固定顶棚支架）。
       若未满足上述条件，仍可能被认定为违法改装。
       
   • 营运车辆额外处罚：若厢式货车为营运车辆（如货运公司所有），除上述处罚外，还可能因违反《道路运输条例》第三十条（“禁止使用改装、拼装车辆从事货运”），面临交通运输部门的额外罚款或停业整顿。

4. 处理流程建议

   • 配合执法：现场接受交警处罚时，需出示驾驶证、行驶证及车辆登记证书，如实说明改装原因。
     
   • 整改与复检：若被责令恢复原状，应尽快到正规维修厂整改，并联系交警部门复检，避免因未整改导致车辆年检受阻。
     
   • 行政复议或诉讼：若认为处罚不当（如车辆实际未改装或已备案），可在收到处罚决定书后60日内申请行政复议，或6个月内直接向法院提起行政诉讼。

温馨提示：若您的车辆因开顶被查处，建议优先确认改装是否经过车管部门备案，并尽快整改以避免进一步损失。如有其他疑问，可直接向我咨询具体法律问题。