农民工工资超过6000元是否需要纳税，需根据具体情况判断，但一般而言，若月工资6000元且无其他扣除项目，则需缴纳部分税款；若有专项扣除或专项附加扣除等，则可能无需缴税。以下是详细分析：

一、应纳税所得额的计算

农民工工资纳税的起点与其他劳动者一致，均适用5000元的月费用减除标准。根据《中华人民共和国个人所得税法》第六条，居民个人的综合所得（包括工资、薪金所得）以每一纳税年度的收入额，减除费用六万元（折算到每月为5000元），以及专项扣除（如“三险一金”）、专项附加扣除（如子女教育、住房贷款利息等）和依法确定的其他扣除后的余额，作为应纳税所得额。

举例说明：

• 若农民工小李月工资6000元，且没有其他扣除项目，则其应纳税所得额 = 6000元 - 5000元 = 1000元。根据个人所得税税率表，这1000元对应的税率为3%，因此小李当月需缴纳的税款为1000元 * 3% = 30元。
• 若小李有每月1000元的专项附加扣除（如子女教育或住房贷款利息等），则其应纳税所得额 = 6000元 - 5000元 - 1000元 = 0元，当月无需缴纳税款。

二、税率及速算扣除数

个人所得税采用超额累进税率，税率范围为3%至45%，具体根据全年应纳税所得额划分级数。对于月工资6000元的情况，若应纳税所得额为1000元，则适用税率为3%，速算扣除数为0。

三、申报与缴纳

农民工取得综合所得时，如有扣缴义务人（如用人单位），则由扣缴义务人按月或按次预扣预缴税款。次年三月一日至六月三十日内，需办理汇算清缴，以确保税款的准确缴纳。预扣预缴办法由国务院税务主管部门制定。

四、免税项目与减税政策

税法还规定了若干免税项目和减税政策。例如，抚恤金、救济金等特定收入免税；残疾人、孤老人员等特定情况可享受减税优惠。农民工在了解自身纳税义务的同时，也应关注这些优惠政策，以确保合法权益得到保障。

总结与建议：

农民工工资纳税遵循统一的个人所得税标准，具体纳税额取决于个人月收入、扣除项目及税法规定的免税、减税政策。因此，不能简单地以月工资是否超过6000元来判断是否需要纳税。建议农民工朋友在收到工资后，及时了解自己的纳税义务和权益，确保合法合规纳税，同时享受应有的税收优惠。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。