针对你提出的问题，“两个人结婚了但是没有结婚证女方跑掉了但是有小孩可以去法院起诉吗”，我的回答是：可以去法院起诉。以下是对此问题的详细分析：

1. 事实婚姻关系：

   • 虽然双方没有结婚证，但如果存在事实婚姻关系，即双方以夫妻名义共同生活并育有子女，那么这种关系在法律上是有一定效力的。
   • 在事实婚姻关系下，如果女方擅自离开，且涉及子女抚养问题，男方有权向法院起诉，要求女方承担抚养责任。

2. 子女抚养权与抚养费：

   • 无论双方是否存在结婚证，子女都有被抚养的权利。
   • 女方作为母亲，有抚养子女的责任。如果女方离开且未履行抚养义务，男方可以向法院起诉，要求女方支付抚养费。
   • 法院会根据实际情况，如女方的收入、子女的实际需求以及当地生活水平等因素，判定女方应支付的抚养费数额。

3. 财产分割：

   • 如果双方在同居期间有共同财产，且无法协商分割，男方也可以向法院起诉，要求依法分割共同财产。

4. 起诉流程：

   • 男方需要向法院提交起诉状和相关证据材料，如子女的出生证明、双方的聊天记录、共同财产的证明等。
   • 如果女方下落不明，法院会采用公告送达的方式向对方送达诉讼文书，并进行缺席审理和判决。

综上所述，即使双方没有结婚证，但如果存在事实婚姻关系且涉及子女抚养或财产分割等问题，男方有权向法院起诉。在起诉前，建议男方收集好相关证据材料，并咨询专业律师以获取更详细的法律建议。如果你有任何进一步的问题或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。