政府采购合同款原则上不可以由别的公司代收，但在特定条件下，经过严格程序，可以变更收款主体。以下是对此问题的详细分析：

一、不可随意委托收款的原则

政府采购活动作为公共财政支出的重要组成部分，其规范性和严肃性不容忽视。在政府采购中，中标公司与采购人签订的采购合同是明确双方权利义务关系的关键法律文件，其中关于收款账户等条款更是合同的核心内容。根据相关规定和实际操作要求：

1. 资金支付审核严格：政府采购使用的是财政性资金，支付环节需严格审核，确保中标通知书、合同和发票上的供应商名称以及收款方账户信息一致。
2. 违约风险：如果中标公司未经采购人同意擅自委托其他公司收款，将可能违反合同约定，构成违约行为，采购人有权追究其违约责任。
3. 财务风险和违规操作：此种行为还可能导致资金流向不透明，增加财务风险和违规操作的可能性，损害政府采购活动的公正性和合法性。

二、特殊情况下的合法变更程序

尽管原则上不允许委托其他公司代为收款，但在确有合理原因的情况下，中标公司可以向采购人提出书面申请，详细说明委托收款的原因及受托公司的基本情况。采购人在收到申请后，应进行严格的审核评估，确保变更不会对采购项目造成不利影响。若审核通过，双方需签订补充协议，明确变更后的收款主体信息等相关内容，以此作为合同的有效补充，使委托收款行为合法化。

三、法律风险的防范

中标公司在考虑委托收款时，应充分评估法律风险，谨慎决策，避免因违规行为而承担不必要的法律责任。具体来说：

1. 遵守法律法规：中标公司应严格遵守政府采购的法律法规和支付程序要求，确保资金支付的合法性和透明度。
2. 谨慎决策：在考虑委托收款时，应充分评估法律风险，包括但不限于违约风险、财务风险和违规操作风险等。
3. 签订补充协议：若确实需要变更收款主体，应与采购人签订补充协议，明确双方的权利义务关系，确保变更行为的合法性和有效性。

建议：中标公司在处理政府采购合同款收款问题时，应严格遵守相关法律法规和合同约定，确保资金支付的合法性和透明度。如有特殊情况需要变更收款主体，应提前与采购人沟通并签订补充协议，以避免不必要的法律风险。若您在政府采购合同款收款方面遇到任何法律问题，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律意见和帮助。