村主任因冤案被停发工资的，补发工资的法律依据主要涉及《国家赔偿法》及相关司法解释中关于侵犯公民人身权、财产权的赔偿规定，具体需结合冤案性质及工资停发原因综合判断。以下分情况详细说明：

1. 若冤案涉及刑事司法错误（如被错误拘留、逮捕或判刑）

根据《国家赔偿法》第三十三条、第三十四条：

• 赔偿范围：若村主任因刑事冤案被错误限制人身自由（如拘留、逮捕、判刑），导致无法正常履职而停发工资的，国家需赔偿其被羁押期间的工资损失。
• 计算标准：赔偿金按作出赔偿决定时的上年度职工日平均工资计算（每日赔偿金=国家上年度职工日平均工资×被羁押天数）。若工资高于该标准，可主张按实际工资损失补发（需提供工资证明等证据）。
• 法律依据：
  
  • 《国家赔偿法》第三十三条：“侵犯公民人身自由的，每日赔偿金按照国家上年度职工日平均工资计算。”
    
  • 《最高人民法院关于人民法院赔偿委员会审理国家赔偿案件适用精神损害赔偿若干问题的意见》中关于“误工损失”的认定原则。

2. 若冤案涉及行政处罚错误（如被错误行政拘留、撤职等）

根据《国家赔偿法》第四条、第三十六条：

• 赔偿范围：若村主任因行政机关错误行政处罚（如错误撤职、停职）导致工资停发，且该处罚被依法撤销的，行政机关需赔偿其工资损失。
• 计算标准：按实际停发工资的金额补发，需提供工资发放记录、行政处罚决定书及撤销决定等证据。
• 法律依据：
  
  • 《国家赔偿法》第四条：“行政机关及其工作人员在行使行政职权时有下列侵犯财产权情形之一的，受害人有取得赔偿的权利：……（三）违法征收、征用财产的；（四）造成财产损害的其他违法行为。”
    
  • 第三十六条：“侵犯公民、法人和其他组织的财产权造成损害的，按照下列规定处理：……（八）对财产权造成其他损害的，按照直接损失给予赔偿。”

3. 若冤案涉及民事纠纷或内部处分（如被村民误解、内部停职）

• 法律性质：此类情形通常不属于国家赔偿范围，需通过其他途径解决：
  
  • 民事纠纷：若因村民误解导致工资停发，可依据《民法典》中关于“名誉权”“侵权责任”的规定，要求侵权人停止侵害、赔偿损失（包括工资损失）。
    
  • 内部处分：若因村委会内部程序错误被停职，可依据《村民委员会组织法》相关规定，要求村委会撤销错误决定并补发工资。

4. 操作建议

1. 收集证据：保留工资条、停发通知、冤案相关法律文书（如撤销判决、赔偿决定书）等。
   
2. 确定责任主体：根据冤案性质，明确应由国家机关（如公安机关、法院）还是村委会、村民承担赔偿责任。
   
3. 申请赔偿或诉讼：
   
   • 对国家机关：向赔偿义务机关提出书面赔偿申请，或直接向法院赔偿委员会申请作出赔偿决定。
     
   • 对村委会或村民：通过调解、仲裁或民事诉讼主张权利。
     

提示：具体案件需结合证据和当地司法实践分析，若涉及复杂程序或证据收集困难，可进一步向我咨询细节。