公司货款从员工个人账户给第三方，其合法性取决于具体的操作方式和情境。以下是对此问题的详细分析：
一、合法情形
存在合法业务背景：
- 若公司因特定业务需求，如向个人采购货物或服务，并已取得合规发票，此时将货款支付至员工个人账户（需确保该员工是受公司委托进行采购的合法代理人），再由该员工账户转至第三方（即供应商）个人账户，这种转账行为在业务逻辑上是合理的，且不违反法律规定。但需注意，整个转账过程应透明、可追溯，并确保所有税务处理合规。
特定支付需求：
- 在某些特殊情况下，如第三方（如海外供应商）不接受公司账户直接转账，或因银行系统限制等原因，公司可能需通过员工个人账户进行中转。这种情况下，若公司能提供充分的证据证明转账的合理性和必要性，且所有税务和法律手续完备，该行为可能被视为合法。
二、不合法情形
偷税漏税：
- 若公司通过将货款转入员工个人账户来逃避纳税义务，如未将该笔收入纳入公司财务报表，或未依法代扣代缴相关税费，则构成偷税漏税行为。这种行为不仅违反了税收法律法规，还可能面临补缴税款、滞纳金及罚款等处罚，甚至可能构成犯罪，承担刑事责任。
挪用资金或侵占公司财产：
- 若公司管理人员或其他人员未经授权，擅自将公司货款转入员工个人账户，并用于个人用途或非公司业务，则可能构成挪用资金罪或职务侵占罪。根据刑法规定，此类行为将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役和罚金等。
洗钱：
- 若公司货款来源非法，如走私、贩毒、诈骗等所得，通过转入员工个人账户进行资金转移和“洗白”，则构成洗钱犯罪。洗钱罪将依据犯罪情节的严重程度，对行为人处以有期徒刑、拘役和罚金等刑罚。
三、法律建议与风险防范
完善内部控制：
- 公司应建立健全的内部控制制度，明确货款支付流程和审批权限，确保所有转账行为都有明确的业务背景和合法的税务处理。同时，应加强对员工账户的管理和监控，防止员工滥用职权进行违法转账。
加强财务管理：
- 公司应加强财务管理和会计核算工作，确保所有收入和支出都纳入公司财务报表，并依法进行税务申报和缴纳。对于通过员工个人账户进行转账的情况，应建立详细的转账记录和审批流程，以备税务和法律审查。
咨询专业法律意见：
- 在涉及复杂或高风险的转账行为时，公司应咨询专业律师或会计师的意见，以确保合规性并降低法律风险。
若您对公司货款从员工个人账户给第三方的合法性仍有疑问，或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。