在交通事故中，即使车主承担次要责任，若其侵权行为导致摩托车主（主要责任方）人身损害并产生误工损失，车主也需按照责任比例赔偿摩托车主的误工费。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》第一千一百七十九条：明确规定，侵害他人造成人身损害的，应当赔偿因误工减少的收入等合理费用。这构成了车主赔偿误工费的基本法律依据。
2. 《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条：指出机动车之间发生交通事故时，双方都有过错的，应按照各自过错的比例分担责任。这意味着车主需根据其责任比例来承担误工费的赔偿责任。
3. 《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第七条：详细说明了误工费的计算方式，即根据受害人的误工时间和收入状况来确定。

二、赔偿原则与比例

1. 赔偿原则：只要事故造成了对方人身损害并导致其误工损失，侵权人（包括车主）就应当承担相应的赔偿责任。
2. 责任划分与赔偿比例：在事故责任划分为主次责任的情况下，车主通常需要按照一定的责任比例赔偿对方的损失。这个比例一般介于30%至40%之间，但具体比例可能因地区差异和案件具体情况而有所调整。例如，如果交警认定车主承担30%的责任，且摩托车主因受伤误工产生了10000元的误工费损失，那么车主就需赔偿10000元乘以30%，即3000元。

三、特殊情况下的处理

1. 证据不足时的处理：误工费的赔偿需要有充分的证据支持。如果摩托车主无法提供有效的误工证明、收入减少证明等相关证据，车主可能无需赔偿误工费或者只需赔偿合理部分。
2. 存在免责事由时的处理：如果车主能够证明存在法定的免责事由，如不可抗力、受害人故意等，可以减轻或免除其赔偿责任。
3. 保险赔付的考虑：如果事故车辆投保了机动车第三者责任强制保险和商业保险，保险公司可能在保险责任限额范围内承担部分或全部赔偿责任。但具体赔付情况还需根据保险合同条款来确定。

四、实际操作建议

1. 证据收集：摩托车主在主张误工费赔偿时，应尽可能提供全面的证据材料，如工资单、工作合同、医疗证明等，以支持其索赔请求。车主在应对此类索赔时，也应要求对方提供充分的证据。
2. 法律咨询与诉讼：在处理此类纠纷时，建议双方咨询专业律师以获取更准确的法律意见和指导。如果协商不成，摩托车主可以向法院提起诉讼，要求车主按照责任比例赔偿误工费。

举例说明：假设车主与摩托车主发生交通事故，交警认定车主负次要责任，摩托车主负主要责任。摩托车主因伤住院治疗一个月，期间无法上班，单位停发工资8000元。若车主的侵权行为与摩托车主的受伤存在因果关系，且当地司法实践中机动车间次要责任赔偿比例为30%，则车主需赔偿摩托车主误工费2400元（8000元×30%）。若车主购买了足额的交强险和商业三者险，这部分费用将由保险公司根据保险合同和事故责任进行赔付。

综上所述，车主在交通事故中承担次要责任时，仍需按照责任比例赔偿摩托车主的误工费。具体赔偿金额和方式需根据受害人的实际损失、责任比例以及保险合同条款等因素综合确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。