结论：签完行政不予处罚笔录后40天过去，并不能直接判断案件的严重程度。案件的严重程度需结合具体案情、违法行为的性质、情节以及社会危害程度等多方面因素综合考量。以下是对此问题的详细分析：
一、行政不予处罚笔录的性质与意义
行政不予处罚笔录，通常是在行政机关对涉嫌违法行为进行调查后，认为违法行为轻微，依法不予行政处罚时所制作的笔录。这份笔录记录了行政机关对案件的调查过程、事实认定以及不予处罚的理由和依据。它并不直接反映案件的严重程度，而是行政机关对案件处理结果的一种记录。
二、案件严重程度的判断标准
案件的严重程度并非仅由时间因素决定，而是需要综合考虑以下多个方面：
违法行为的性质：不同性质的违法行为，其严重程度自然不同。例如，故意伤害他人身体与轻微违反交通规则，两者的严重程度显然不可同日而语。
违法行为的情节：即使性质相同的违法行为，情节不同，严重程度也会有所差异。例如，盗窃少量财物与盗窃大量财物，情节轻重明显不同。
社会危害程度：违法行为的后果对社会造成的危害程度，也是判断案件严重程度的重要依据。例如，环境污染行为对生态环境造成的破坏程度，直接反映了其社会危害性的大小。
三、40天过去后的可能情况
签完行政不予处罚笔录后40天过去，可能意味着以下几种情况：
行政机关已作出最终处理决定：如果行政机关在调查后认为违法行为轻微，依法不予行政处罚，并已经制作了不予处罚决定书，那么40天后，这份决定书可能已经生效。但这并不直接说明案件的严重程度，只是表明行政机关对案件的处理态度。
案件仍在进一步调查中：虽然已经制作了不予处罚笔录，但行政机关可能仍在收集证据、调查取证，以进一步确认违法行为的性质、情节和社会危害程度。在这种情况下，40天过去并不意味着案件已经了结，也不能直接判断案件的严重程度。
存在其他法律程序：例如，如果当事人对不予处罚决定不服，可能依法申请行政复议或提起行政诉讼。在这种情况下，40天过去可能只是法律程序中的一个时间节点，并不能直接反映案件的严重程度。
四、建议与提醒
关注行政机关的通知：如果案件仍在处理中，建议密切关注行政机关的通知和要求，及时配合调查和取证工作。
了解自身权益：如果对行政机关的处理决定有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身合法权益。
咨询专业律师：如果对案件的严重程度、处理程序或法律后果等方面存在疑问，建议咨询专业律师，以获取更全面、准确的法律意见。
如有任何法律问题，可以直接向我咨询，我会尽我所能为你提供专业的法律帮助。