结论：是否可以起诉标书公司未上传标书，需根据具体情况判断，主要取决于未上传标书是否构成违约或侵权，以及是否因此给您造成了实际损失。以下从不同角度进行分析：
一、合同关系角度
若存在书面合同：
- 如果您与标书公司之间签订了书面合同，且合同中明确规定了标书公司需按时上传标书，而标书公司未履行该义务，则构成违约。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
- 因此，您有权要求标书公司承担违约责任，包括但不限于赔偿因未上传标书而给您造成的实际损失。
若不存在书面合同：
- 如果双方未签订书面合同，但存在口头约定或事实上的合同关系（如通过电子邮件、微信等聊天记录可以证明双方存在委托制作并上传标书的约定），且标书公司未履行上传义务，同样可能构成违约。
- 在这种情况下，您也可以尝试通过协商、调解或诉讼等方式要求标书公司承担相应的责任。但需要注意的是，口头约定的证明难度较大，可能需要提供其他证据来支持您的主张。
二、侵权责任角度
若未上传标书导致您遭受损失：
- 如果标书公司未上传标书的行为导致您遭受了实际损失（如因错过投标时间而失去项目机会、因标书内容缺失而影响评分等），且该损失与标书公司的行为之间存在因果关系，则标书公司可能构成侵权。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。
- 因此，您有权要求标书公司赔偿因侵权行为给您造成的实际损失。
若未上传标书未导致您遭受损失：
- 如果标书公司未上传标书的行为并未给您造成实际损失，或者您无法证明损失与标书公司的行为之间存在因果关系，则可能难以构成侵权。
- 在这种情况下，您要求标书公司承担责任的主张可能难以得到法院的支持。
三、实际操作建议
收集证据：
- 无论您选择从合同关系还是侵权责任角度主张权利，都需要收集充分的证据来支持您的主张。这包括但不限于合同文本、聊天记录、邮件往来、损失证明等。
协商调解：
- 在提起诉讼之前，您可以尝试与标书公司进行协商或调解，以寻求双方都能接受的解决方案。这有助于节省时间和成本，并维护双方的商业关系。
提起诉讼：
- 如果协商调解无果，您可以考虑向法院提起诉讼。在提起诉讼时，您需要准备充分的证据材料，并明确您的诉讼请求和事实理由。
总结：是否可以起诉标书公司未上传标书，需根据具体情况判断。如果您认为标书公司的行为构成违约或侵权，并给您造成了实际损失，那么您有权要求标书公司承担相应的责任。在实际操作中，建议您收集充分的证据材料，并咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。