关于私企能否查阅真假学历信息的问题，这实际上涉及到两个层面：一是私企是否有权查询学历信息的真实性，二是如何合法合规地进行查询。
首先，从法律和政策的角度来看，私企本身并不直接拥有查询员工或应聘者学历信息真实性的官方权限。学历信息的核实通常需要通过官方渠道，如教育部指定的学历查询网站（如学信网）或相关教育机构进行。私企在招聘或员工管理过程中，可以要求应聘者或员工提供学历证明文件，并进行初步的形式审查，但无法直接通过私企自身的渠道验证学历的真伪。
然而，在实际操作中，私企为了确保招聘的公正性和员工信息的真实性，通常会采取以下措施来间接核实学历信息：
要求提供官方学历证明：如毕业证书、学位证书的原件或复印件，并可能要求应聘者提供学信网的学历认证报告。
进行背景调查：在招聘高级职位或关键岗位时，私企可能会委托专业的背景调查机构对应聘者的学历、工作经历等信息进行核实。
利用官方查询渠道：虽然私企不能直接查询学历信息的真实性，但可以指导应聘者或员工通过官方渠道（如学信网）进行自我查询，并提供查询结果作为证明。
至于您提到的《经营主体登记档案管理办法》，该办法主要规范的是经营主体（包括私企）的登记档案查询和管理，与学历信息的查询并不直接相关。该办法明确了哪些主体可以查询经营主体的登记档案，以及查询时需要提供的材料和遵守的规定，但并未涉及学历信息的查询。
总结来说，私企在招聘或员工管理过程中，无法直接通过自身渠道查询学历信息的真实性，但可以通过要求提供官方学历证明、进行背景调查或利用官方查询渠道等方式来间接核实。同时，私企在处理员工信息时，应严格遵守相关法律法规，保护员工的隐私和个人信息安全。