第二次劳动能力鉴定时，鉴定机构是会知道这是第二次鉴定的情况的。以下从不同角度为你详细分析：

鉴定流程与信息记录角度

在劳动能力鉴定的流程中，每一次的鉴定申请、受理、鉴定过程以及结果等关键信息，都会被详细记录在相关的档案和系统中。当劳动者提出第二次劳动能力鉴定申请时，受理机构在审核申请材料和进行后续操作时，会查阅之前的鉴定记录。这是为了确保鉴定的连续性和准确性，避免重复劳动和可能出现的矛盾鉴定结果。例如，如果第一次鉴定是因为某种特定伤情给出了相应的等级评定，第二次鉴定时鉴定机构需要了解第一次鉴定的具体情况，包括伤情描述、鉴定依据等，以便更全面、准确地评估劳动者的劳动能力状况。

法律规定与程序要求角度

从法律和程序层面来看，劳动能力鉴定有着严格的规定和要求。相关法律法规可能并未直接明确规定鉴定机构必须知晓第二次鉴定的情况，但在实际操作中，为了保障鉴定的公正性和合法性，鉴定机构需要掌握完整的鉴定历史信息。这是因为第二次鉴定往往是在对第一次鉴定结果有异议的情况下提出的，鉴定机构需要了解第一次鉴定的全过程，包括鉴定所依据的标准、方法、证据等，以便对劳动者的劳动能力进行重新评估。如果鉴定机构不了解第一次鉴定的情况，可能会导致鉴定结果的不一致或不合理，进而引发更多的争议和纠纷。

实际操作与避免矛盾角度

在实际操作中，如果第二次鉴定机构不知道这是第二次鉴定，可能会出现与第一次鉴定结果相互矛盾的情况。这不仅会给劳动者带来不必要的困扰和损失，也会影响劳动能力鉴定制度的权威性和公信力。因此，为了确保鉴定结果的准确性和一致性，鉴定机构在受理第二次鉴定申请时，会主动查询和了解第一次鉴定的相关信息。

建议：如果你正在面临第二次劳动能力鉴定的情况，不必担心鉴定机构是否知晓这是第二次鉴定。相反，你应该积极配合鉴定机构的工作，提供完整、准确的鉴定材料和相关信息，以便鉴定机构能够更全面、准确地评估你的劳动能力状况。如果你对鉴定结果有异议或疑问，也可以及时向鉴定机构提出，并寻求专业的法律帮助和建议。有问题可以直接向我咨询，我会为你提供专业的解答。