水利建设工程项目预付款支付合同总价50%的情况需分情形讨论，现行法律未直接禁止但需满足特定条件，具体分析如下：

1. 法律框架下的预付款比例限制
   根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》第五十八条及《建设工程施工合同（示范文本）》（GF-2017-0201）通用条款，法律未对预付款比例设定上限，但明确要求预付款比例需在合同中约定。若合同双方通过协商一致将预付款设定为合同总价的50%，且不违反以下条件，则具有法律效力：
   

• 合同条款未违反《民法典》第一百四十三条关于民事法律行为效力的规定（如不存在欺诈、胁迫、恶意串通等情形）；
  
• 预付款支付后，承包人需按合同约定提供等额预付款保函或担保，以保障发包人资金安全；
  
• 合同未违反行业主管部门对特定类型项目的资金监管要求（如涉及财政资金的水利项目可能需符合《政府投资条例》中关于资金拨付的规定）。

1. 行业惯例与风险防控建议
   尽管法律未限制比例，但实践中预付款通常不超过合同总价的30%，主要原因包括：
   

• 发包人风险：过高预付款可能导致承包人挪用资金或履约能力不足，建议要求承包人提供银行保函、担保公司担保或抵押质押等增信措施；
  
• 承包人义务：需在合同中明确预付款的抵扣方式（如按工程进度逐步扣回）及未履行合同时的返还责任；
  
• 审计合规性：若项目涉及国有资金或财政审计，需确保预付款比例符合《基本建设财务规则》中关于资金拨付进度的要求，避免被认定为“超进度支付”。

1. 特殊情形下的调整空间
   若项目存在以下情形，50%预付款比例的合理性需进一步论证：
   

• 承包人资信状况：如承包人信用评级较低或过往项目存在违约记录，发包人可要求降低预付款比例；
  
• 项目复杂程度：对于技术难度高、工期长的水利项目（如跨流域调水工程），承包人前期资金投入较大，可协商提高预付款比例；
  
• 地方性法规：部分省份可能出台水利工程建设管理办法，对预付款比例设定地方标准（如某省规定预付款不得超过合同价的20%），需以当地规定为准。

实务操作建议：若您拟在合同中约定50%预付款，建议：

1. 在合同中明确预付款的支付条件（如提交履约保函后X日内支付）、抵扣方式（如按每月完成工程量的50%扣回）及违约责任；
   
2. 要求承包人提供与预付款金额等值的担保，并办理担保登记手续；
   
3. 咨询当地水利主管部门或审计机构，确认预付款比例是否符合行业监管要求。
   

如有具体合同条款或项目背景需进一步分析，可直接向我提供详细信息。