结论：店休3天是否扣员工工资，需根据具体情况判断，主要看店休是因公司原因还是员工原因，以及公司规章制度和劳动合同中的相关规定。
分析如下：
因公司原因导致的店休：
- 若公司规章制度或劳动合同中有明确规定：例如，规定因公司原因导致的店休，员工工资不受影响或按一定比例发放，那么公司应按照这些规定执行，不得随意扣减员工工资。
- 若公司规章制度或劳动合同中无明确规定：根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。因此，在这种情况下，公司通常应支付员工全额工资，不得扣减。但若停工、停产超过一个工资支付周期，且劳动者没有提供正常劳动的，公司可以按照不低于当地最低工资标准的70%支付劳动者生活费（具体比例可能因地区而异）。不过，这一规定主要针对的是长期停工停产的情况，对于短期的店休（如3天），一般仍应支付全额工资。
因员工原因导致的店休：
- 如果店休是由于员工个人的原因（如请假、旷工等），那么公司有权根据规章制度或劳动合同中的规定，对员工进行相应的工资扣减。但扣减的幅度和方式应合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
公司规章制度和劳动合同的约定：
- 无论哪种情况，公司都应确保其规章制度和劳动合同中的规定合法、合理，且已向员工明确告知。如果公司规章制度或劳动合同中的规定与法律法规相冲突，那么这些规定将被视为无效，公司应按照法律法规的规定执行。
建议：
- 对于员工：如果遇到公司因店休而扣减工资的情况，首先应查看公司规章制度和劳动合同中的相关规定，了解自己的权益。如果认为公司的扣减行为不合理或违法，可以与公司进行协商，或向劳动监察部门投诉，甚至通过法律途径维护自己的合法权益。
- 对于公司：在制定规章制度和劳动合同时，应确保相关规定合法、合理，并明确告知员工。在因店休等特殊情况需要调整员工工资时，应提前与员工进行沟通，并按照法律法规和规章制度的规定执行，以避免不必要的劳动纠纷。
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