核心结论：公司签的船员资历不合格，可从与公司协商、向相关部门投诉举报、通过法律途径解决这三个方向来处理，以下为你详细阐述：
- 与公司协商
- 沟通内容：首先，尝试与公司进行友好且诚恳的沟通。向公司明确指出船员资历不合格这一情况，说明资历不合格可能带来的风险和问题，例如可能违反行业规定、影响船舶航行安全、面临监管处罚等。要求公司采取措施解决，比如更换合格的船员或者对现有船员进行培训使其达到合格标准。
- 协商要点：在协商过程中，要注意保留好沟通的记录，如邮件、聊天记录等。这些记录在后续如果需要进一步维权时，可以作为证据证明你已经与公司就资历不合格问题进行了沟通，以及公司的态度和回应。
- 向相关部门投诉举报
- 投诉部门：如果与公司协商无果，可以向相关的海事管理部门或者劳动监察部门进行投诉举报。海事管理部门负责监管船舶和船员的相关事务，对于船员资历不合格影响船舶安全运营的情况有监管职责；劳动监察部门则主要监管企业的劳动用工行为，如果公司存在明知船员资历不合格仍安排上岗等违反劳动法律法规的行为，劳动监察部门可以介入调查处理。
- 投诉材料：在投诉时，需要准备好相关的证据材料，如船员的资历证书、公司的用工合同、与公司沟通的记录等，以证明船员资历不合格的事实以及公司的相关行为。相关部门在接到投诉后，会进行调查核实，并根据调查结果采取相应的措施，如责令公司整改、对公司进行处罚等。
- 通过法律途径解决
- 法律依据：如果因为船员资历不合格给你造成了实际的损失，例如因为船舶被处罚导致你的工作受到影响、公司以此为由克扣工资等，你可以依据《中华人民共和国劳动合同法》《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，通过法律途径维护自己的合法权益。
- 诉讼流程：你可以先向公司发出律师函，明确指出公司的违法行为以及你要求赔偿的诉求，给公司一个合理的期限来解决问题。如果公司在期限内仍未作出合理回应，你可以向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请仲裁或者向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，要提供充分的证据来支持自己的主张，如工资条、工作记录、损失证明等。