商品房买卖合同备案后确实可以注销，但具体能否注销以及注销的流程，需依据不同情况和当地政策规定来确定。以下是对此问题的详细解答：
一、可申请合同备案注销的情形
购房人因特殊原因需退房：
- 若购房人因家庭变故、经济困难等特殊原因需要退房，并能提供相关证明材料（如医院诊断证明、经济困难证明等），则可以申请合同备案注销。
买卖双方协商一致解除合同：
- 在合同履行过程中，若买卖双方经协商一致同意解除合同，并签订了解除合同协议，那么也可以申请合同备案注销。
存在重复签约等违规操作：
- 如因工作人员失误导致同一套房屋重复签约，或开发商存在一房多卖等违规操作，相关当事人（如购房者、其他受影响的购房者或开发商）可以申请合同备案注销。
其他符合规定的情形：
- 如购房人死亡且无合法继承人、法院判决或仲裁机构裁决解除合同等情形，也可依法申请合同备案注销。
二、合同备案注销的具体流程
提交申请材料：
- 申请人需向当地房地产管理部门提交书面申请及相关证明材料，包括身份证明、合同原件、解除协议（如有）、法院判决书或仲裁裁决书（如有）、特殊原因证明材料（如适用）等。
审核与受理：
- 房地产管理部门会对申请材料进行审核，确认是否符合注销条件。符合条件的，将予以受理并启动注销程序。
公示与异议处理（部分地区要求）：
- 部分地区可能要求对拟注销的合同进行公示，接受社会监督。公示期间如有异议，相关部门会进行调查核实并作出相应处理。
办理注销手续：
- 经审核无误且无异议的，房地产管理部门将办理合同备案注销手续，并在系统中更新相关信息，完成注销。
三、注意事项
及时沟通：
- 在申请合同备案注销前，建议买卖双方及时沟通并达成一致意见，以避免产生不必要的纠纷。
了解政策：
- 不同地区对于合同备案注销的政策规定可能存在差异，建议在申请前详细了解当地的相关政策和操作流程，以确保申请的顺利进行。
保留证据：
- 在申请过程中，应妥善保管好相关证明材料和文件，以备后续查询和维权之需。
总结：商品房买卖合同备案后虽然可以注销，但具体能否注销以及注销的流程需根据实际情况和当地政策规定来确定。如遇相关问题或纠纷，建议及时咨询专业律师或当地房地产管理部门以获取法律帮助和支持。