运输企业两客一危监控员未监控到位发生重大交通事故，其处罚需从行政责任、刑事责任以及民事责任三个角度进行全面分析：

1. 行政责任：

   • 根据《中华人民共和国道路运输条例》及相关规定，运输企业有责任确保其车辆的安全运营，包括设置有效的监控系统并确保监控员履行职责。若监控员未监控到位导致重大交通事故，运输企业可能面临交通运输主管部门的行政处罚，如罚款、停业整顿、吊销相关经营许可等。
   • 同时，监控员个人也可能因失职行为受到行政处分，如警告、记过、降级、撤职等，具体依据企业内部规章制度及行业管理规定执行。

2. 刑事责任：

   • 若监控员的失职行为构成犯罪，如交通肇事罪或重大责任事故罪，将依法追究其刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役；交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑；因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。
   • 在此情况下，监控员作为直接责任人员，若其失职行为与事故发生有直接因果关系，且达到刑事立案标准，将可能面临上述刑事处罚。

3. 民事责任：

   • 运输企业及监控员还可能因未履行安全保障义务而承担民事赔偿责任。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。
   • 在此案例中，若监控员的失职行为导致事故发生，造成他人人身伤害或财产损失，运输企业及监控员（若其行为构成共同侵权或单独侵权）需承担相应的民事赔偿责任，包括赔偿医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、死亡赔偿金以及财产损失等。

建议：

• 运输企业应加强对监控员的培训和管理，确保监控系统有效运行，及时发现并纠正驾驶员的违规行为，预防事故发生。
• 监控员应严格履行职责，保持高度警惕，确保监控到位，及时发现并报告异常情况。
• 若发生事故，运输企业及监控员应积极配合相关部门调查处理，承担相应责任，并采取措施防止类似事故再次发生。

若您在交通运输（事故责任）领域有任何法律问题，欢迎直接向我咨询。