针对您提出的“行政复议机关在三个月期满后仍未作出且超过了诉讼时效怎么办”的问题，以下是我的详细解答：

1. 行政复议机关未在法定期限内作出复议决定的情况

   • 根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，行政复议机关应当自受理申请之日起六十日内作出行政复议决定；但是法律规定的行政复议期限少于六十日的除外。情况复杂，不能在规定期限内作出行政复议决定的，经行政复议机关的负责人批准，可以适当延长，并告知申请人和被申请人；但是延长期限最多不超过三十日。若行政复议机关在三个月（即九十日，考虑了可能的延长情况）期满后仍未作出复议决定，这构成了程序上的违法。

2. 超过诉讼时效的后果及应对措施

   • 诉讼时效的起算与期限：一般来说，行政诉讼的起诉期限为知道或应当知道行政行为作出之日起六个月内，但经过行政复议的案件，起诉期限为收到复议决定书之日起十五日内，或者复议机关逾期不作决定的，申请人可以在复议期满之日起十五日内向人民法院提起诉讼。若您提到的“超过了诉讼时效”是指已经超过了上述起诉期限，那么从法律程序上讲，您可能失去了通过行政诉讼途径寻求救济的权利。
   • 特殊情况下的救济：尽管超过了起诉期限，但在某些特殊情况下，如因不可抗力或者其他正当理由耽误法定申请期限的，申请期限自障碍消除之日起继续计算。若您能证明存在此类特殊情况，并得到法院的认可，那么您仍有可能获得诉讼救济。
   • 其他救济途径：若行政诉讼途径已不可行，您还可以考虑通过其他方式寻求救济，如向相关行政机关提出申诉、举报或投诉，或者寻求媒体、社会组织的帮助等。虽然这些方式不具有法律强制力，但有时也能起到一定的推动作用。

3. 建议与行动指南

   • 核实诉讼时效：首先，您需要仔细核实自己是否确实已经超过了起诉期限。这包括确认行政复议决定的作出时间（或应作出时间）、自己收到复议决定的时间（或复议期满的时间）以及提起诉讼的时间等。
   • 咨询专业律师：若您对诉讼时效的计算或是否存在特殊情况有疑问，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见。律师可以根据您的具体情况，分析您是否还有可能通过法律途径寻求救济。
   • 考虑其他救济方式：若行政诉讼途径已不可行，您可以考虑上述提到的其他救济途径，并积极采取行动以维护自己的合法权益。

总结来说，若行政复议机关在三个月期满后仍未作出复议决定，且您已经超过了起诉期限，那么从法律程序上讲，您可能失去了通过行政诉讼途径寻求救济的权利。但您仍可以核实诉讼时效、咨询专业律师并考虑其他救济方式以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。