申请人对残联作出的最终结论不服，一般情况下是可以提出行政复议申请的，但具体还需根据该结论的性质和残联的组织性质来判断。以下从不同角度进行分析：
残联结论的性质：
- 如果残联作出的结论属于具体行政行为，即直接针对特定申请人，对其权利义务产生实际影响的决定或命令，那么申请人对此不服，有权依法提出行政复议申请。例如，残联对申请人的残疾等级评定、残疾证发放等具体事项作出的决定，如果申请人认为这些决定侵犯了其合法权益，可以申请行政复议。
残联的组织性质：
- 残联作为群众团体，其性质并非行政机关。然而，根据相关法律法规和政策规定，残联在特定事项上可能被授权或委托行使一定的行政管理职能。在这种情况下，残联作出的具有行政管理性质的结论，申请人同样可以申请行政复议。但需要注意的是，如果残联的结论并非基于行政授权或委托，而是基于其群众团体的性质作出的，那么该结论可能不属于行政复议的受理范围。
行政复议的受理范围：
- 根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，公民、法人或者其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，可以自知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。因此，如果残联作出的结论属于具体行政行为，且申请人认为该行为侵犯了其合法权益，那么申请人有权在法定期限内提出行政复议申请。
法律建议：
- 申请人应首先明确残联作出的结论是否属于具体行政行为，以及该结论是否对其权利义务产生了实际影响。
- 如果确认该结论属于可复议的范围，申请人应在法定期限内（一般为知道该具体行政行为之日起六十日内）向有管辖权的行政复议机关提出申请。
- 在提出行政复议申请时，申请人应准备充分的证据材料，以支持其复议请求。
可能的法律后果：
- 如果行政复议机关认为残联的结论确实存在违法或不当之处，可能会撤销、变更或确认该结论违法，并责令残联重新作出具体行政行为。
- 如果行政复议机关认为残联的结论合法、适当，可能会维持该结论，驳回申请人的复议请求。
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