结论：业主赔付违约金退房时，销售是否还会扣除佣金，这主要取决于销售佣金的支付条件、合同约定以及退房的具体原因。以下从不同角度进行分析：
合同约定优先：
- 如果业主与销售方（或开发商）签订的购房合同中明确规定了，在业主退房并赔付违约金的情况下，销售方仍有权扣除或保留已支付或应支付的佣金，那么销售方有权按照合同约定执行。
- 反之，如果合同中没有明确约定，或者约定了销售方在退房情况下不得扣除佣金，那么销售方则无权扣除。
佣金支付条件：
- 佣金通常是销售方为促成交易而获得的报酬。如果交易（即房屋买卖）因业主退房而未能完成，销售方可能主张其未完成销售任务，从而要求扣除或不予支付佣金。
- 但另一方面，如果销售方已经完成了其销售职责（如提供了销售服务、协助签订了购房合同等），且退房并非由于销售方的过错导致，那么销售方可能主张其有权获得部分或全部佣金。
退房原因的影响：
- 如果业主退房是因为销售方存在过错（如虚假宣传、隐瞒房屋瑕疵等），那么业主可能有权要求销售方不仅不扣除佣金，还要承担其他赔偿责任。
- 如果退房是因为业主自身原因（如资金问题、个人喜好变化等），且合同中没有特别约定，那么销售方可能更有理由主张扣除佣金。
实际操作中的考量：
- 在实际操作中，销售方可能会根据具体情况和合同条款，与业主进行协商，以达成双方都能接受的解决方案。
- 如果双方无法协商一致，可能需要通过法律途径解决争议，如诉讼或仲裁。
建议：
- 业主在签订购房合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于佣金支付和退房责任的部分，以确保自己的权益得到保障。
- 如果发生退房情况，业主应与销售方进行积极沟通，尽量通过协商解决问题。
- 如果协商无果，业主可以寻求法律帮助，咨询专业律师以了解自己的权利和义务，并考虑通过法律途径维护自己的权益。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。