在自家的宅基地上种棉花并不违法。以下从不同角度为你详细分析：

法律角度

宅基地是农村村民用于建造住宅及其附属设施的集体建设用地，包括住房、附属用房和庭院等用地。根据我国相关法律法规，宅基地的使用权归村民个人所有，村民有权在宅基地上建造住宅及其附属设施，并从事与居住生活相关的活动。种植棉花属于农业生产活动的一种，且棉花并非违禁作物，因此，在自家的宅基地上种植棉花，并未违反任何法律法规的规定。

实际操作角度

1. 土地用途：虽然宅基地主要用于建造住宅及其附属设施，但并未严格禁止在宅基地的空闲部分进行农业生产活动。只要不影响住宅的安全和使用，以及不妨碍村庄的整体规划和公共利益，种植棉花等农作物是可行的。
2. 相邻关系：在种植棉花时，也需要注意与相邻宅基地的使用人保持和谐的关系。避免因种植活动（如浇水、施肥等）对相邻宅基地造成损害或影响，从而引发不必要的纠纷。

特殊情况考虑

1. 宅基地规划：如果宅基地所在地区有特定的规划要求，比如需要保留一定的绿化空间或禁止进行农业生产活动等，那么在这种情况下种植棉花可能会受到限制。但这种情况较为少见，且通常会有明确的规划文件或通知。
2. 土地性质变更：如果宅基地的土地性质发生了变更，比如被征收为国有土地或转为其他用途的土地，那么在该土地上种植棉花就可能不再合法。但这种情况通常会有明确的法律程序和通知，且会涉及土地补偿等问题。

建议：在自家的宅基地上种植棉花是合法的，但也要注意遵守当地的法律法规和规划要求，以及与相邻宅基地的使用人保持和谐的关系。如果有任何疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律建议和指导。