结论：行政案件被当作民事案件处理，且判决书遗漏事实的情况下，上诉后能否转回行政案件审理，需根据具体情况判断，一般情况下不能直接转回行政案件审理，但可通过上诉程序纠正错误并请求发回重审或依法改判。以下从不同角度进行分析：

一、案件性质与审理程序

1. 案件性质决定审理程序：行政案件与民事案件在审理程序、法律适用、举证责任等方面存在显著差异。行政案件主要审查行政行为的合法性，而民事案件则主要解决平等主体之间的纠纷。因此，案件性质的错误认定会直接影响审理程序的适用。

2. 一审错误认定案件性质：若一审法院将行政案件错误地当作民事案件审理，这属于程序违法。根据《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释，当事人有权对此提出上诉，请求二审法院纠正一审法院的错误。

二、上诉后的处理方式

1. 上诉请求与理由：在上诉时，当事人应明确指出一审法院将行政案件当作民事案件审理的错误，并请求二审法院撤销原判决，将案件发回重审或依法改判。同时，当事人还可以就判决书遗漏的事实进行补充说明，请求二审法院予以认定。

2. 二审法院的处理：

   • 若二审法院认为一审法院确实错误认定了案件性质：二审法院可能会撤销原判决，并将案件发回一审法院重新审理。在重新审理时，一审法院应按照行政案件的审理程序进行审理。
   • 若二审法院认为一审法院虽然错误认定了案件性质，但案件事实清楚、法律适用正确：二审法院可能会直接改判，但这种情况较为少见，因为案件性质的错误认定通常会导致审理程序的根本性错误。
   • 针对判决书遗漏事实的情况：无论二审法院是否认为一审法院错误认定了案件性质，只要判决书遗漏了重要事实，二审法院都应在查明事实的基础上，对遗漏的事实进行认定，并据此作出判决。

三、实际操作中的建议

1. 及时上诉：若当事人发现一审法院将行政案件当作民事案件审理，且判决书遗漏了重要事实，应及时提出上诉，以免错过上诉期限。

2. 充分准备上诉材料：在上诉时，当事人应准备充分的上诉材料，包括上诉状、证据材料等，以证明一审法院的错误和遗漏的事实。

3. 寻求专业法律帮助：由于行政案件与民事案件在审理程序、法律适用等方面存在显著差异，当事人在上诉过程中可寻求专业律师的帮助，以确保上诉请求的合理性和合法性。

进一步思考：在实际操作中，案件性质的认定往往较为复杂，需要综合考虑案件的具体情况、相关法律法规以及司法实践等因素。因此，当事人在遇到类似情况时，应保持冷静，及时寻求专业法律帮助，以维护自己的合法权益。若您有任何法律问题，都可以直接向我咨询。