工会工作机构在组织架构和财务管理上需保持一定的独立性，但并非在所有方面都必须完全独立，具体需分情况讨论：

一、组织架构的独立性

工会作为职工自愿结合的工人阶级群众组织，其组织架构的独立性主要体现在其设立、运行和决策机制上。工会应依法独立自主地开展工作，不受企业行政方面的干涉。这种独立性确保了工会能够真正代表职工的利益，维护职工的合法权益。然而，这并不意味着工会工作机构在所有方面都必须与企业完全隔绝。在实际操作中，工会工作机构可能会与企业行政方面有一定的协作和沟通，以便更好地开展工作，但这并不影响其独立性的本质。

二、财务管理的独立性

在财务管理方面，工会工作机构的独立性则更为明确和具体。根据相关规定和实践经验，工会经费应当独立核算，这是工会财务管理的重要原则。具体来说：

1. 独立核算要求：

   • 企业工会组织应单独设置会计账套，进行独立核算。这有助于清晰反映工会经费的收支情况，便于工会组织内部管理以及接受会员监督。
   • 工会经费应建立独立的经费账户，实行专款专用，不能与企业其他经费混合使用或挪用。这确保了工会经费的独立性和合法性，是维护职工权益、促进工会活动正常开展的重要保障。

2. 特殊情况处理：

   • 对于规模较小、业务相对简单的企业工会，若经上级工会同意，可以不单独设置账套。但在此情况下，至少应在企业账务中对工会经费进行明细核算，确保工会经费与企业其他费用能够清晰区分。

3. 基层工会联合会等组织的独立核算：

   • 基层工会联合会等组织，由于管理多个基层工会的经费，同样需要实行独立核算。这有助于准确反映其自身的财务状况和业务活动情况，有利于资金的统筹安排和有效监管。

三、法律背景与建议

工会工作机构的独立性，特别是财务管理的独立性，是保障工会正常运作和职工权益的重要基础。如果工会工作机构在财务管理上缺乏独立性，可能会导致工会经费的滥用或挪用，进而损害职工的利益。因此，无论是企业工会还是基层工会联合会等组织，都应严格遵守相关法律法规和财务制度的规定，确保工会经费的独立性和合法性。

建议：

• 工会应建立健全的财务管理制度，确保工会经费的独立核算和专款专用。
• 企业应尊重工会的独立性，不得干涉工会的正常工作和财务管理。
• 职工应积极参与工会的活动，监督工会经费的使用情况，维护自身的合法权益。

如果您在工会工作机构的独立性方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。