工伤职工因与公司有纠纷而离职，是否有经济补偿金需视具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：
一、员工主动离职的情况
一般情况：
- 若工伤职工主动提出离职，且用人单位在劳动合同履行过程中无过错（如按时足额支付工资、依法缴纳社会保险等），则通常不享有经济补偿金。这是因为劳动者基于自身意愿主动解除劳动合同，不符合用人单位支付经济补偿金的法定情形。
因用人单位过错导致的离职：
- 若用人单位存在法定过错，如未按照劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等，工伤职工以此为由主动离职时，有权要求用人单位支付经济补偿金。具体过错情形包括但不限于：康复后未安排适合的工作岗位、未支付停工留薪期工资、未缴纳社会保险、规章制度违反法律法规损害劳动者权益等。
- 经济补偿金的计算方式：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
二、用人单位提出解除劳动合同的情况
合法解除：
- 若用人单位与工伤职工协商一致或依据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条、第四十一条规定解除劳动合同，需支付经济补偿金，标准同上。例如，若工伤职工因工伤无法继续从事原工作，且用人单位无法为其安排其他合适的工作岗位，双方协商一致解除劳动合同的，用人单位需支付经济补偿金。
违法解除：
- 若用人单位违反《中华人民共和国劳动合同法》规定解除与工伤职工的劳动合同，工伤职工有权要求继续履行劳动合同或要求用人单位按经济补偿标准的二倍支付赔偿金。例如，若用人单位在工伤职工医疗期内或停工留薪期内擅自解除劳动合同，即构成违法解除，需承担相应的法律责任。
三、工伤职工离职时的其他权益
- 无论离职原因如何，工伤职工均享有离职时的其他相关权益。根据《工伤保险条例》等规定，工伤职工在离职时可能享受一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金。这些补助金分别由工伤保险基金和用人单位支付，用于工伤复发时的治疗费用和因工伤导致的就业能力受损的补偿。具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定。
四、实际操作建议
- 明确离职原因：工伤职工在离职前，应明确离职原因，并保留相关证据，以便后续维权。例如，若因用人单位过错导致离职，应收集相关证据证明用人单位的过错行为。
- 了解法律法规：工伤职工应充分了解相关法律法规，特别是关于经济补偿金和工伤补助金的规定。这有助于工伤职工在离职时维护自己的合法权益。
- 及时咨询：在涉及法律争议时，工伤职工可以直接向我咨询，以获取准确的法律意见和帮助。
综上所述，工伤职工因与公司有纠纷而离职时，是否有经济补偿金需根据具体情况进行判断。若用人单位存在过错或工伤导致职工无法继续工作且用人单位已缴纳工伤保险，则工伤职工在离职时有权要求经济补偿。同时，无论离职原因如何，工伤职工均享有离职时的其他相关权益。