关于土地管理法中违规种植的处罚问题，需结合具体违规情形及法律规定来分析，核心结论是：违规种植的处罚方式主要包括责令限期改正、罚款、没收违法所得，情节严重的还可能面临刑事处罚。以下分情况详细说明：
占用基本农田发展林果业或挖塘养鱼 根据《土地管理法》第三十七条及《基本农田保护条例》第十七条，禁止占用基本农田发展林果业或挖塘养鱼。若违反此规定，由县级以上人民政府自然资源主管部门、农业农村主管部门等依据职责责令限期改正；逾期不改正的，按占用面积处耕地开垦费2倍以上5倍以下的罚款；破坏种植条件的，还需依照《土地管理法》第七十五条处罚，即责令限期改正或治理，可并处罚款（罚款额为耕地开垦费的5倍以上10倍以下；构成犯罪的，依法追究刑事责任）。
在耕地上种植非粮食作物（非基本农田） 若占用一般耕地种植非粮食作物（如经济作物、林木等），虽不直接违反“基本农田保护”规定，但需符合土地利用总体规划及农业结构调整要求。若未改变土地用途（仍为农用地），通常不涉及行政处罚；但若通过非法手段改变土地用途（如将耕地转为建设用地），则按非法占用土地处罚，即责令退还土地、限期拆除或没收地上建筑物，并处罚款（罚款额为非法占用土地每平方米100元以上1000元以下）。
破坏耕地种植条件 若违规种植行为导致耕地耕作层破坏（如深耕改种、填埋等），按《土地管理法》第七十五条处罚：责令限期改正或治理，恢复原种植条件；逾期不改正的，处耕地开垦费5倍以上10倍以下罚款；构成犯罪的（如非法占用农用地罪），依法追究刑事责任（处五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金）。
涉及污染或生态破坏的种植 若种植行为导致土壤污染或生态破坏（如使用禁用农药、过度施肥等），除按《土地管理法》处罚外，还可能涉及《环境保护法》《土壤污染防治法》等规定，需承担环境修复责任及行政处罚（如罚款、责令停产整治等）。
建议：若您涉及具体违规种植情形，需结合土地性质（基本农田/一般耕地）、种植作物类型、是否改变土地用途等关键因素综合判断。如有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您详细分析。