当单位员工发生脑出血且单位不认定为工伤时，赔偿问题需要根据具体情况来分析和处理。以下是一些建议，希望能为您提供帮助：
一、明确脑出血原因
首先，要明确脑出血是否与工作有关。如果脑出血是由于工作原因导致的，如工作压力过大、工作时间过长等导致的身体损伤，那么即使单位不认定为工伤，员工也有权利通过法律途径争取自己的权益。
二、了解相关法律法规
工伤认定：根据《工伤保险条例》，员工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害或者患职业病，应当认定为工伤。如果单位不认定为工伤，员工可以向当地社会保险行政部门申请工伤认定。
赔偿标准：如果脑出血被认定为工伤，员工将享受工伤保险待遇，包括医疗费用、康复费用、停工留薪期间的工资福利等。如果单位未参加工伤保险，那么这些费用应由单位承担。
非工伤赔偿：如果脑出血未被认定为工伤，但确实是由于单位的原因（如工作环境恶劣、管理不善等）导致的，员工可以依据《民法典》等相关法律法规，要求单位承担民事赔偿责任。
三、与单位协商
在明确脑出血原因和了解相关法律法规后，建议员工首先与单位进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。协商过程中，可以提出自己的合理诉求，如医疗费用、误工费等，并保留好相关证据。
四、申请仲裁或诉讼
如果协商无果，员工可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼。在申请仲裁或诉讼前，建议咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及相关的法律程序和证据要求。
五、注意事项
保留证据：无论是协商、仲裁还是诉讼，都需要有充分的证据来支持自己的主张。因此，建议员工在脑出血发生后，及时收集并保留好相关证据，如医疗记录、工作记录、证人证言等。
及时咨询专业律师：在处理此类纠纷时，由于涉及的法律问题较为复杂，建议员工及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。
综上所述，当单位员工发生脑出血且单位不认定为工伤时，员工应根据具体情况采取相应措施来维护自己的权益。同时，也要注意保留好相关证据和咨询专业律师的意见。