结论前置：公司合伙人使用私账发工资是否违法，需结合具体情况判断，主要涉及税务合规、公司财务制度及劳动法相关规定。以下从不同角度详细分析：

1. 税务合规角度

根据《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则，公司作为纳税主体，需依法进行税务登记、申报和缴纳税款。工资发放属于公司经营行为的一部分，应通过公司对公账户进行，以确保税务合规。若合伙人使用私账发放工资，可能涉及以下税务风险：

• 未代扣代缴个人所得税：公司有义务代扣代缴员工的个人所得税。若通过私账发放工资，可能因未履行代扣代缴义务而面临税务处罚。
• 隐瞒收入或虚列成本：私账发放工资可能被视为隐瞒公司收入或虚列成本，从而逃避企业所得税等税种的缴纳，这也是税务违法行为。

建议：为避免税务风险，公司应严格通过公账发放工资，并依法履行代扣代缴个人所得税的义务。

2. 公司财务制度角度

公司财务制度通常要求所有经济业务通过公司对公账户进行，以确保财务透明度和合规性。若合伙人使用私账发放工资，可能违反公司财务制度，导致以下后果：

• 财务混乱：私账发放工资可能导致公司财务记录不完整、不准确，影响公司财务管理和决策。
• 内部纠纷：若合伙人之间或合伙人与员工之间因工资发放问题产生纠纷，私账发放可能加剧矛盾，损害公司利益。

建议：公司应建立健全的财务制度，明确工资发放流程和方式，确保所有经济业务通过公司对公账户进行。

3. 劳动法角度

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，公司应按时足额支付员工工资，且工资支付方式应符合法律法规和公司规章制度。若合伙人使用私账发放工资，可能涉及以下劳动法问题：

• 工资支付方式不合法：若公司规章制度或劳动合同中明确规定了工资支付方式（如通过银行转账至员工指定账户），而合伙人却通过私账发放，可能构成违约行为。
• 损害员工权益：私账发放工资可能导致员工无法及时、准确地收到工资，损害员工的合法权益。

建议：公司应遵守劳动法规定，按时足额支付员工工资，并确保工资支付方式合法、合规。若需变更工资支付方式，应提前与员工协商并达成一致意见。

4. 特殊情况下的合法性

在某些特殊情况下，如公司临时资金周转困难、员工个人要求等，合伙人可能通过私账发放工资。但这种情况下，仍需注意以下事项：

• 确保税务合规：即使通过私账发放工资，也应依法履行代扣代缴个人所得税的义务，并保留相关凭证以备税务检查。
• 完善内部手续：公司应完善内部手续，如签订书面协议、记录工资发放情况等，以证明私账发放工资的合法性和合理性。

总结：公司合伙人使用私账发工资是否违法，需结合具体情况判断。为避免法律风险，公司应严格遵守税务、财务和劳动法相关规定，确保工资发放合法、合规。若您在此方面遇到任何问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。